pUC et expression chez E. coli
pUbiAt-LGFP B631
Vecteur de clonage pUC avec Ubq10–Link-GFP, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| NcoIC^CATGG | 113 | entre ColE1 et UBQ10 |
| NotIGC^GGCCGC | 119 | entre ColE1 et UBQ10 |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 119 | entre ColE1 et UBQ10 |
| BbsI (BpiI)GAAGAC(2/6) | 1 406 | dans int |
| SpeIA^CTAGT | 1 602 | entre UBQ10 et link |
| BamHIG^GATCC | 1 608 | entre UBQ10 et link |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1 616 | entre UBQ10 et link |
| PstICTGCA^G | 1 624 | entre UBQ10 et link |
| HindIIIA^AGCTT | 1 632 | entre UBQ10 et link |
| MluIA^CGCGT | 1 638 | entre UBQ10 et link |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 1 644 | entre UBQ10 et link |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 2 041 | dans gfpm |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 2 186 | dans int |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 2 272 | dans gfpm |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 2 631 | dans Tocs |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2 819 | entre Tocs et Amp |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2 821 | entre Tocs et Amp |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 2 842 | entre Tocs et Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2 848 | entre Tocs et Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 4 348 | dans Amp |
Double coupure : EcoRI (786, 1 626), SalI (964, 2 611), SacI (103, 1 219), BglII (1 531, 2 831), EcoRV (1 429, 1 462), SfiI (118, 2 825), PvuII (2 969, 5 482), XmnI (387, 3 814), SapI (1 224, 5 419).
Aucun site : SphI, XhoI, NdeI, NheI, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, HpaI, NsiI, SacII, AatII, BstEII, AarI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 2
- Ubq10
- Gène 2
- Link-GFP
- Caractéristiques
- dicotylédones
- Autres marqueurs
- Amp
- Taille
- 5 601 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 08-FEB-2016
Construction
- UBQ10–gfpm · Tocs · cassette avec insert, 126–2 811
- MCS · 7 sites uniques · en 1 602, 1 644
- SfiI ×2 · encadre la cassette UBQ10–gfpm · en 118, 2 825
Ligation of B629p35s-LGFP* into 204pUbiAtmu-ocs*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| UBQ10 | Autre misc_feature | 126 | 1 601 | 1 476 | + |
| Ubi cds 5 | Promoteur misc_feature | 1 230 | 1 293 | 64 | + |
| int | Site misc_feature | 1 296 | 1 599 | 304 | + |
| link | Autre misc_feature | 1 650 | 1 700 | 51 | + |
| gfpm | Séquence codante CDS | 1 701 | 2 079 | 379 | + |
| int | Site CDS | 2 080 | 2 268 | 189 | + |
| gfpm | Séquence codante CDS | 2 269 | 2 606 | 338 | + |
| Tocs | Terminateur misc_feature | 2 616 | 2 811 | 196 | + |
| Amp | Marqueur de sélection misc_feature | 3 627 | 4 487 | 861 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 4 530 | 5 246 | 717 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
pUbiAt-LGFP (B631; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pUbiAt-LGFP)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.