pUC et expression chez E. coli
pet28-MBP-NLS-Mad7-NLS F460
Vecteur d’expression pour E. coli avec MAD7.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 67 | entre lacI et ORF-1 |
| NdeICA^TATG | 160 | dans ORF-1 |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 225 | dans malE (mutated) |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 452 | dans malE (mutated) |
| BamHIG^GATCC | 1 326 | dans ORF-1 |
| SalIG^TCGAC | 1 345 | entre ORF-1 et TEV |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 1 408 | dans Mad7 |
| HindIIIA^AGCTT | 2 743 | dans Mad7 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 2 972 | dans Mad7 |
| PstICTGCA^G | 5 241 | entre Mad7 et NLS |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 5 278 | dans ORF-1 |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 6 509 | dans aph(3')-Ia |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 7 698 | entre aph(3')-Ia et bom |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 9 479 | dans lacI |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 10 215 | entre lacI et ORF-1 |
Double coupure : SacI (1 272, 1 342), NcoI (106, 1 123), MluI (2 782, 9 682), NsiI (6 271, 6 537).
Aucun site : NotI, SpeI, AscI, PacI, SfiI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, MfeI, AgeI, StuI, AflII, EagI, SacII, AatII, AarI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Gène 2
- MAD7
- Taille
- 10 403 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 20-APR-2023
Ligation of PCR Mad7 TEV* into F455pet28-MBP-HisOpti*
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| ORF-1 | Séquence codante CDS | 137 | 1 345 | 1 209 | + |
| ORF-1' | Séquence codante CDS | 137 | 1 345 | 1 209 | + |
| thrombin recognition and cleavage site | Site CDS | 141 | 158 | 18 | + |
| malE (mutated) | Séquence codante CDS | 162 | 1 262 | 1 101 | + |
| TEV | Site CDS | 1 351 | 1 373 | 23 | + |
| start | Site misc_feature | 1 374 | 1 376 | 3 | + |
| Mad7 | Séquence codante CDS | 1 374 | 5 231 | 3 858 | + |
| 'NLS | Site misc_feature | 5 242 | 5 277 | 36 | + |
| ORF-1 | Séquence codante CDS | 5 242 | 5 304 | 63 | + |
| 6xHis affinity tag | Site CDS | 5 284 | 5 301 | 18 | + |
| aph(3')-Ia | Séquence codante CDS | 6 000 | 6 815 | 816 | − |
| bom | Origine / squelette misc_feature | 7 711 | 7 853 | 143 | − |
| rop | Séquence codante CDS | 7 955 | 8 146 | 192 | − |
| lacI | Séquence codante CDS | 8 955 | 10 037 | 1 083 | − |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
pet28-MBP-NLS-Mad7-NLS (F460; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pet28-MBP-NLS-Mad7-NLS; RRID:SCR_029231)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.