p5o2x35s-UbiZm-LH B513
Vetor binário com 2x35s–EPSPS, para monocotiledôneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 2.524 | em epsps |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 3.198 | entre TE9 e UbiZm |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 3.239 | entre TE9 e UbiZm |
| SpeIA^CTAGT | 4.760 | entre UbiZm e Tnos |
| BamHIG^GATCC | 4.766 | entre UbiZm e Tnos |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 4.774 | entre UbiZm e Tnos |
| EcoRIG^AATTC | 4.784 | entre UbiZm e Tnos |
| HindIIIA^AGCTT | 4.790 | entre UbiZm e Tnos |
| SalIG^TCGAC | 4.802 | entre UbiZm e Tnos |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 4.849 | em Tnos |
| PacITTAAT^TAA | 5.114 | entre Tnos e RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 5.180 | entre Tnos e RB |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 11.266 | em Sm/Sp |
Corte duplo: KpnI (5.091, 5.148), XhoI (1.098, 3.950), NcoI (3.224, 4.297), NheI (4.370, 9.901), BglII (4.197, 5.131), ClaI (4.483, 9.981), EcoRV (966, 5.692), ApaI (4.310, 5.142), MluI (2.888, 4.796), SfiI (3.229, 5.125), FseI (7.452, 9.557), BsiWI (3.246, 9.785), AgeI (10.395, 10.703), NsiI (4.528, 4.940), AatII (5.098, 5.571), XmnI (601, 926), SapI (6.624, 10.521).
Sem sítio: SacI, AscI, AvrII, BstBI, HpaI, StuI, BsrGI, PvuII, AarI.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 1
- 2x35s
- Gene 1
- EPSPS
- Promotor 2
- UbiZm
- Gene 2
- MCS
- Características
- monocotiledôneas
- Outros marcadores
- Sm/Sp
- Tamanho
- 12.419 bp, circular
- Data do registro
- 08-FEB-2016
Construção
- P2x35s–EPSPS · TE9 · cassete de seleção, 314–3.188
- UbiZm–(vazio)–Tnos · cassete de expressão vazio, 3.252–5.073
- MCS · 7 sítios únicos · em 4.760, 4.849
- SfiI ×2 · flanqueia o cassete UbiZm–(empty)–Tnos · em 3.229, 5.125
- Bordas do T-DNA · LB, RB
Ligation of 594pUbi-BA* into B482p5o2x35s-LH*
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Borda do T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P2x35s | Promotor misc_feature | 314 | 1.098 | 785 | + |
| EPSPS | Sequência codificadora CDS | 1.116 | 1.856 | 741 | + |
| int | Sítio misc_feature | 1.857 | 2.045 | 189 | + |
| epsps | Sequência codificadora CDS | 2.046 | 2.888 | 843 | + |
| TE9 | Terminador misc_feature | 2.898 | 3.188 | 291 | + |
| UbiZm | Promotor misc_feature | 3.252 | 4.759 | 1.508 | + |
| Int | Sítio misc_feature | 4.238 | 4.757 | 520 | + |
| Tnos | Terminador misc_feature | 4.820 | 5.073 | 254 | + |
| RB | Borda do T-DNA misc_feature | 5.196 | 5.219 | 24 | + |
| ColE1 | Origem / backbone misc_feature | 5.754 | 6.451 | 698 | + |
| pVS1 | Origem / backbone misc_feature | 7.000 | 10.705 | 3.706 | + |
| Sm/Sp | Marcador de seleção CDS | 10.889 | 11.899 | 1.011 | + |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
p5o2x35s-UbiZm-LH (B513; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p5o2x35s-UbiZm-LH)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.