p6o-LH-35s-LmEGFP D365
Vetor binário com 35s–hptII e 35s–link-mEGFP, para dicotiledôneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 303 | entre LB e P35S |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 727 | entre P35S e Kozak |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2.270 | entre TE9 e 35S-Pro |
| NcoIC^CATGG | 2.296 | entre TE9 e 35S-Pro |
| SpeIA^CTAGT | 2.736 | em 35S-Pro |
| BamHIG^GATCC | 2.743 | entre 35S-Pro e Linker |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 2.751 | entre 35S-Pro e Linker |
| EcoRIG^AATTC | 2.761 | entre 35S-Pro e Linker |
| HindIIIA^AGCTT | 2.767 | entre 35S-Pro e Linker |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 2.779 | entre 35S-Pro e Linker |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 3.176 | em mEGFP |
| SalIG^TCGAC | 3.746 | entre mEGFP e OCS |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 3.956 | entre OCS e RB |
| BglIIA^GATCT | 3.966 | entre OCS e RB |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 3.977 | entre OCS e RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3.983 | entre OCS e RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 4.015 | entre OCS e RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 4.406 | entre RB e ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 8.620 | em pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 8.736 | em pVS1 |
Corte duplo: PstI (2.270, 2.759), SphI (2.276, 4.140), NdeI (5.521, 7.280), ClaI (3.407, 8.816), MluI (1.960, 2.773), SfiI (2.301, 3.960), FseI (6.287, 8.392), AgeI (9.230, 9.538), StuI (1.641, 3.954), SacII (1.115, 1.945), BstEII (1.035, 10.101), SapI (5.459, 9.356).
Sem sítio: SacI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, HpaI, NsiI, PvuII, AarI.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 1
- 35s
- Gene 1
- hptII
- Promotor 2
- 35s
- Gene 2
- link-mEGFP
- Características
- dicotiledôneas
- Outros marcadores
- Sm/Sp
- Tamanho
- 11.254 bp, circular
- Data do registro
- 26-AUG-2020
Construção
- P35S–hptII · TE9 · cassete de seleção, 309–2.260
- 35S-Pro–mEGFP · OCS · cassete com inserto, 2.315–3.946
- MCS · 6 sítios únicos · em 2.736, 2.779
- SfiI ×2 · flanqueia o cassete 35S-Pro–mEGFP · em 2.301, 3.960
- Bordas do T-DNA · LB, RB
Ligation of D360p35s-LmEGFP* into B413p6o-LH*
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Borda do T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P35S | Promotor misc_feature | 309 | 724 | 416 | + |
| Kozak | Sítio misc_feature | 740 | 744 | 5 | + |
| hptII | Marcador de seleção CDS | 745 | 1.314 | 570 | + |
| int | Sítio misc_feature | 1.315 | 1.503 | 189 | + |
| hptII | Marcador de seleção CDS | 1.504 | 1.959 | 456 | + |
| TE9 | Terminador misc_feature | 1.970 | 2.260 | 291 | + |
| 35S-Pro | Promotor misc_feature | 2.315 | 2.737 | 423 | + |
| TATA | Sítio CDS | 2.703 | 2.709 | 7 | + |
| Linker | Sequência codificadora CDS | 2.785 | 2.835 | 51 | + |
| mEGFP | Sequência codificadora CDS | 2.836 | 3.214 | 379 | + |
| F64L/S65T - enhanced fluorescence | Sítio misc_feature | 3.025 | 3.030 | 6 | + |
| ST-LS1 | Sequência codificadora CDS | 3.215 | 3.403 | 189 | + |
| mEGFP | Sequência codificadora CDS | 3.404 | 3.741 | 338 | + |
| A206K - monomeric protein | Sítio misc_feature | 3.640 | 3.642 | 3 | + |
| OCS | Terminador misc_feature | 3.751 | 3.946 | 196 | + |
| RB | Borda do T-DNA misc_feature | 4.031 | 4.054 | 24 | + |
| ColE1 | Origem / backbone misc_feature | 4.589 | 5.286 | 698 | + |
| bom | Origem / backbone misc_feature | 5.323 | 5.582 | 260 | + |
| pVS1 | Origem / backbone misc_feature | 5.835 | 9.540 | 3.706 | + |
| Sm/Sp | Marcador de seleção CDS | 9.724 | 10.734 | 1.011 | + |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
p6o-LH-35s-LmEGFP (D365; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6o-LH-35s-LmEGFP)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.