p7o2x35soR-2XU10 E282
Vetor binário com 2x35s–bar.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 1.098 | entre P2x35s' e Bar' |
| AarICACCTGC(4/8) | 1.639 | em 'Bar' |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2.176 | entre E9 e Pro-Ubq10At |
| NcoIC^CATGG | 2.202 | entre E9 e Pro-Ubq10At |
| SpeIA^CTAGT | 3.691 | entre Pro-Ubq10At e NOS-T |
| BamHIG^GATCC | 3.700 | entre Pro-Ubq10At e NOS-T |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 3.838 | em NOS-T |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 3.979 | entre NOS-T e Pro-Ubq10At |
| HindIIIA^AGCTT | 5.478 | entre Pro-Ubq10At e OCS |
| MluIA^CGCGT | 5.487 | entre Pro-Ubq10At e OCS |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 5.701 | entre OCS e RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 5.730 | entre OCS e RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 5.762 | entre OCS e RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 6.153 | entre RB e ColE1 |
| FseIGGCCGG^CC | 8.960 | em pVS1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 9.188 | em pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 9.304 | em pVS1 |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 9.384 | em pVS1 |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 10.669 | em Sm/Sp |
Corte duplo: EcoRI (2.875, 4.652), PstI (2.176, 5.473), SphI (2.182, 5.887), SacI (3.308, 5.085), NdeI (7.268, 7.848), SfiI (2.207, 5.707), MfeI (14, 1.456), AgeI (9.798, 10.106), AflII (3.747, 5.703), SacII (1.739, 1.756), BsmBI (3.976, 5.513).
Sem sítio: AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, BsrGI, PvuII.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 1
- 2x35s
- Gene 1
- bar
- Promotor 2
- Ubq10
- Outros marcadores
- Bar', 'Bar', Sm/Sp
- Tamanho
- 11.822 bp, circular
- Data do registro
- 16-SEP-2020
Construção
- P2x35s–Bar · E9 · cassete de seleção, 314–2.166
- Pro-Ubq10At–(vazio)–NOS-T · cassete de expressão vazio, 2.215–3.971
- Pro-Ubq10At–(vazio)–OCS · cassete de expressão vazio, 3.992–5.693
- SfiI ×2 · flanqueia 2 cassetes · em 2.207, 5.707
- Bordas do T-DNA · LB, RB
Ligation of C971pU10Tnos-U10Tocs* into D783p7o2x35soR-LH*
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Borda do T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P2x35s' | Promotor misc_feature | 314 | 1.098 | 785 | + |
| Bar' | Marcador de seleção CDS | 1.116 | 1.349 | 234 | + |
| STLS1 | Outro misc_feature | 1.350 | 1.538 | 189 | + |
| ''Bar' | Marcador de seleção CDS | 1.539 | 1.856 | 318 | + |
| 'E9 | Terminador misc_feature | 1.876 | 2.166 | 291 | + |
| Pro-Ubq10At | Promotor misc_feature | 2.215 | 3.690 | 1.476 | + |
| TATA | Sítio misc_feature | 3.286 | 3.289 | 4 | + |
| Ubi cds 5` | Sequência codificadora CDS | 3.319 | 3.382 | 64 | + |
| íntron | Outro misc_feature | 3.385 | 3.688 | 304 | + |
| NOS-T | Terminador misc_feature | 3.718 | 3.971 | 254 | + |
| Pro-Ubq10At | Promotor misc_feature | 3.992 | 5.467 | 1.476 | + |
| TATA | Sítio misc_feature | 5.063 | 5.066 | 4 | + |
| Ubi cds 5` | Sequência codificadora CDS | 5.096 | 5.159 | 64 | + |
| íntron | Outro misc_feature | 5.162 | 5.465 | 304 | + |
| OCS | Terminador misc_feature | 5.498 | 5.693 | 196 | + |
| RB | Borda do T-DNA misc_feature | 5.778 | 5.801 | 24 | + |
| ColE1 | Origem / backbone misc_feature | 6.336 | 7.033 | 698 | + |
| 'pVS1 | Origem / backbone misc_feature | 7.321 | 10.108 | 2.788 | + |
| Sm/Sp | Marcador de seleção CDS | 10.292 | 11.302 | 1.011 | + |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
p7o2x35soR-2XU10 (E282; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p7o2x35soR-2XU10)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.