p9D35s-35S-mCheriD F669
Vetor binário com 35s–nptII e mCherry, para dicotiledôneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 163 | entre Left Border Region e 35S |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 587 | entre 35S e NptIIo |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 1.115 | em NptIIo |
| FseIGGCCGG^CC | 1.254 | em NptIIo |
| PstICTGCA^G | 1.908 | entre E9 e 35S-Pro |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 1.908 | entre E9 e 35S-Pro |
| NotIGC^GGCCGC | 1.917 | entre E9 e 35S-Pro |
| SpeIA^CTAGT | 1.924 | entre E9 e 35S-Pro |
| BamHIG^GATCC | 1.930 | entre E9 e 35S-Pro |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1.938 | entre E9 e 35S-Pro |
| HindIIIA^AGCTT | 2.365 | entre T-start e mCherry' |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 2.468 | em mCherry' |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2.649 | em mCherry' |
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 2.966 | em mCherry |
| SalIG^TCGAC | 3.291 | entre mCherry e OCS |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 3.311 | em OCS |
| BglIIA^GATCT | 3.511 | entre OCS e Right Border Region |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3.533 | entre OCS e Right Border Region |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 3.565 | em Right Border Region |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 3.690 | em Right Border Region |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 3.956 | em Right Border Region |
Corte duplo: ApaI (688, 3.524), MluI (1.598, 2.371), SfiI (1.916, 3.505), StuI (1.910, 3.499), EagI (1.917, 3.947).
Sem sítio: EcoRI, NcoI, NdeI, NheI, ClaI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, BstBI, NsiI, BsrGI, PvuII, BsaI, SapI.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 1
- 35s
- Gene 1
- nptII
- Gene 2
- mCherry
- Características
- dicotiledôneas
- Outros marcadores
- NptIIo, strep/spec
- Tamanho
- 8.218 bp, circular
- Data do registro
- 05-JUL-2023
Construção
- 35S–NptIIo · E9 · cassete de seleção, 169–1.898
- 35S-Pro–mCherry · OCS · cassete com inserto, 1.942–3.491
- MCS · 6 sítios únicos · em 1.908, 1.938
- SfiI ×2 · flanqueia o cassete 35S-Pro–mCherry · em 1.916, 3.505
- Bordas do T-DNA · LB, RB
Ligation of B893p35S-CheriD-ocs* into D012p9D35s*
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| LB' | Borda do T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| 35S | Promotor misc_feature | 169 | 584 | 416 | + |
| NptIIo | Marcador de seleção CDS | 605 | 903 | 299 | + |
| 'intron | Sequência codificadora CDS | 904 | 1.090 | 187 | + |
| NptIIo | Marcador de seleção CDS | 1.091 | 1.594 | 504 | + |
| 'E9 | Terminador misc_feature | 1.608 | 1.898 | 291 | + |
| 35S-Pro | Promotor misc_feature | 1.942 | 2.360 | 419 | + |
| Minimal promotor | Sítio misc_feature | 2.271 | 2.360 | 90 | + |
| CAAT | Sítio misc_feature | 2.298 | 2.301 | 4 | + |
| TATA | Sítio CDS | 2.330 | 2.336 | 7 | + |
| T-start | Sítio misc_feature | 2.361 | 2.362 | 2 | + |
| mCherry' | Sequência codificadora CDS | 2.388 | 2.767 | 380 | + |
| splice | Sítio misc_feature | 2.764 | 2.767 | 4 | + |
| 'ST-LS1 | Outro misc_feature | 2.785 | 2.954 | 170 | + |
| 'mCherry | Sequência codificadora CDS | 2.966 | 3.287 | 322 | + |
| OCS | Terminador misc_feature | 3.296 | 3.491 | 196 | + |
| Right Border Region | Outro misc_feature | 3.536 | 4.138 | 603 | + |
| RB | Borda do T-DNA misc_feature | 3.581 | 3.604 | 24 | + |
| 'ColE1'' | Origem / backbone misc_feature | 4.152 | 4.810 | 659 | + |
| ''pVS1 ORI''' | Origem / backbone misc_feature | 4.839 | 6.802 | 1.964 | + |
| ParB | Sequência codificadora CDS | 5.165 | 6.340 | 1.176 | + |
| strep/spec | Marcador de seleção CDS | 6.991 | 8.001 | 1.011 | + |
| Left Border Region | Borda do T-DNA misc_feature | 8.069 | 163 | 0 | + |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
p9D35s-35S-mCheriD (F669; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9D35s-35S-mCheriD)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.