p9oU10-ocs-LH B448
Vetor binário com Ubq10–nptII, para dicotiledôneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 1.786 | entre UBQ10 e nptIIo |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 3.107 | entre TE9 e Tocs |
| NcoIC^CATGG | 3.133 | entre TE9 e Tocs |
| SpeIA^CTAGT | 3.146 | entre TE9 e Tocs |
| BamHIG^GATCC | 3.152 | entre TE9 e Tocs |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 3.160 | entre TE9 e Tocs |
| HindIIIA^AGCTT | 3.176 | entre TE9 e Tocs |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 3.396 | entre Tocs e RB |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 3.398 | entre Tocs e RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3.425 | entre Tocs e RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 3.457 | entre Tocs e RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 3.848 | entre RB e ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 8.062 | em pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 8.178 | em pVS1 |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 8.258 | em pVS1 |
Corte duplo: EcoRI (969, 3.170), SalI (1.147, 3.188), PstI (3.107, 3.168), SphI (3.113, 3.582), SacI (1.402, 2.314), NdeI (4.963, 6.722), BglII (1.714, 3.408), ApaI (1.887, 3.419), MluI (2.797, 3.182), SfiI (3.138, 3.402), MfeI (14, 2.207), AgeI (8.672, 8.980), XmnI (570, 2.799), BstEII (2.556, 9.543), AarI (2.277, 2.398).
Sem sítio: AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, NsiI, BsrGI, SacII, PvuII.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 1
- Ubq10
- Gene 1
- nptII
- Gene 2
- MCS
- Características
- dicotiledôneas
- Outros marcadores
- nptIIo, Sm/Sp
- Tamanho
- 10.696 bp, circular
- Data do registro
- 22-JAN-2016
Construção
- UBQ10–nptIIo · TE9 · cassete de seleção, 309–3.097
- MCS · 6 sítios únicos · em 3.107, 3.176
- SfiI ×2 · flanqueia o MCS · em 3.138, 3.402
- Bordas do T-DNA · LB, RB
Ligation of pOCS-BM* into B435p9oU10-LH*
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Borda do T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| UBQ10 | Outro misc_feature | 309 | 1.784 | 1.476 | + |
| Ubi cds 5 | Promotor misc_feature | 1.413 | 1.476 | 64 | + |
| int | Sítio misc_feature | 1.479 | 1.782 | 304 | + |
| nptIIo | Marcador de seleção CDS | 1.804 | 2.102 | 299 | + |
| splice | Sítio misc_signal | 2.099 | 2.102 | 4 | + |
| int | Sítio CDS | 2.103 | 2.289 | 187 | + |
| splice | Sítio misc_signal | 2.288 | 2.291 | 4 | + |
| nptIIo | Marcador de seleção CDS | 2.290 | 2.793 | 504 | + |
| TE9 | Terminador misc_feature | 2.807 | 3.097 | 291 | + |
| Tocs | Terminador misc_feature | 3.193 | 3.388 | 196 | + |
| RB | Borda do T-DNA misc_feature | 3.473 | 3.496 | 24 | + |
| ColE1 | Origem / backbone misc_feature | 4.031 | 4.728 | 698 | + |
| bom | Origem / backbone misc_feature | 4.765 | 5.024 | 260 | + |
| pVS1 | Origem / backbone misc_feature | 5.277 | 8.982 | 3.706 | + |
| Sm/Sp | Marcador de seleção CDS | 9.166 | 10.176 | 1.011 | + |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
p9oU10-ocs-LH (B448; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9oU10-ocs-LH)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.