pU6pp-MiCms1 D522
Vetor CRISPR/Cas com MiCms1.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| NcoIC^CATGG | 1.144 | em Intron |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 1.157 | em Intron |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 1.217 | em Intron |
| BamHIG^GATCC | 1.610 | entre Ubi-int e ORF-1 |
| AarICACCTGC(4/8) | 4.338 | em ORF-1 |
| AgeI (BshTI)A^CCGGT | 4.676 | em ORF-1 |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 4.876 | entre ORF-1 e NOS-T |
| EcoRIG^AATTC | 5.136 | entre NOS-T e U6 Pp |
| PvuIICAG^CTG | 5.324 | em U6 Pp |
| HindIIIA^AGCTT | 5.493 | entre DR e ColE1 |
| SalIG^TCGAC | 5.510 | entre DR e ColE1 |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 6.362 | em Amp |
Corte duplo: XbaI (130, 1.125), SfiI (87, 5.524), MfeI (331, 4.642), NsiI (1.375, 4.999), BsrGI (1.806, 2.766), BsmBI (5.477, 5.509), SapI (3.521, 3.626).
Sem sítio: SphI, KpnI, NotI, SpeI, MluI, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, HpaI, EagI, SacII, AatII, BstEII, BbsI.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 1
- U6
- Gene 2
- MiCms1
- Tamanho
- 7.063 bp, circular
- Data do registro
- 12-JUN-2019
Construção
- Ubi-int–ORF-1 · NOS-T · cassete com inserto, 98–5.132
- U6 Pp (sem scaffold anotado) · cassete de gRNA, 5.142–5.460
Ligation of MiCms1_BamXma* into D054pU6pp-LbCpf1*
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| Ubi-int | Promotor misc_feature | 98 | 1.606 | 1.509 | + |
| Intron | Sítio misc_feature | 1.085 | 1.604 | 520 | + |
| ORF-1 | Sequência codificadora CDS | 1.625 | 4.873 | 3.249 | + |
| NLS | Sítio misc_feature | 1.631 | 1.651 | 21 | + |
| NLS | Sítio misc_feature | 4.823 | 4.869 | 47 | + |
| NOS-T | Terminador misc_feature | 4.879 | 5.132 | 254 | + |
| U6 Pp | Promotor misc_feature | 5.142 | 5.460 | 319 | + |
| DR | Sítio misc_feature | 5.462 | 5.482 | 21 | + |
| ColE1 | Origem / backbone misc_feature | 5.561 | 6.225 | 665 | − |
| Amp | Sítio misc_feature | 6.226 | 25 | 0 | − |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
pU6pp-MiCms1 (D522; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/crispr/pU6pp-MiCms1)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.