p35-OCS-BM
Vetor de clonagem pUC.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 77 | entre ColE1 e 35S-Pro |
| XbaIT^CTAGA | 79 | entre ColE1 e 35S-Pro |
| NcoIC^CATGG | 87 | entre ColE1 e 35S-Pro |
| NotIGC^GGCCGC | 93 | entre ColE1 e 35S-Pro |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 93 | entre ColE1 e 35S-Pro |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 434 | em 35S-Pro |
| SpeIA^CTAGT | 527 | em 35S-Pro |
| BamHIG^GATCC | 534 | entre 35S-Pro e Tocs |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 542 | entre 35S-Pro e Tocs |
| PstICTGCA^G | 550 | entre 35S-Pro e Tocs |
| EcoRIG^AATTC | 552 | entre 35S-Pro e Tocs |
| HindIIIA^AGCTT | 558 | entre 35S-Pro e Tocs |
| MluIA^CGCGT | 564 | entre 35S-Pro e Tocs |
| SalIG^TCGAC | 570 | entre 35S-Pro e Tocs |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 590 | em Tocs |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 778 | entre Tocs e Amp |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 780 | entre Tocs e Amp |
| BglIIA^GATCT | 790 | entre Tocs e Amp |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 801 | entre Tocs e Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 807 | entre Tocs e Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 2.307 | em Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 3.378 | entre ColE1 e 35S-Pro |
Corte duplo: SfiI (92, 784), PvuI (959, 2.004), PvuII (928, 3.441), XmnI (394, 1.773).
Sem sítio: SphI, XhoI, NdeI, NheI, ClaI, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, MfeI, AgeI, BstBI, HpaI, NsiI, BsrGI, SacII, AatII, BstEII, AarI.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 2
- 35s
- Gene 2
- MCS
- Características
- cassete com promotor 35s
- Outros marcadores
- Amp
- Tamanho
- 3.586 bp, circular
- Data do registro
- 14-JUL-2010
Construção
- 35S-Pro–(vazio)–Tocs · cassete de expressão vazio, 106–770
- MCS · 9 sítios únicos · em 527, 590
- SfiI ×2 · flanqueia o cassete 35S-Pro–(empty)–Tocs · em 92, 784
Ligation of 35S into pOCS-BM
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| 35S-Pro | Promotor misc_feature | 106 | 528 | 423 | + |
| Tocs | Terminador misc_feature | 575 | 770 | 196 | + |
| Amp | Marcador de seleção misc_feature | 1.586 | 2.446 | 861 | + |
| ColE1 | Origem / backbone misc_feature | 2.489 | 3.205 | 717 | + |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
p35-OCS-BM (DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/p35-OCS-BM)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.