pHC-ZmUbi-Act E843
Vetor de clonagem pUC.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 807 | em LacZ |
| AgeI (BshTI)A^CCGGT | 1.199 | entre LIR e SIR |
| AscI (SgsI)GG^CGCGCC | 1.736 | entre LIR e pAct |
| FseIGGCCGG^CC | 2.505 | em pAct |
| BbsI (BpiI)GAAGAC(2/6) | 4.141 | em repA |
| AvrII (XmaJI)C^CTAGG | 4.251 | entre repA e T35 |
| NotIGC^GGCCGC | 4.460 | entre T35 e Ubi-int'' |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 4.460 | entre T35 e Ubi-int'' |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 4.700 | em Ubi-int'' |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 9.775 | entre ORF-1 e NOS-T |
| HindIIIA^AGCTT | 10.526 | entre DR e stop |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 10.557 | entre stop e LacZ' |
Corte duplo: EcoRI (2.121, 10.035), BamHI (2.838, 5.975), PstI (4.471, 5.972), XhoI (1.742, 5.166), NheI (5.586, 10.549), EcoRV (3.147, 8.032), SfiI (828, 10.563), BsiWI (1.187, 1.723), PvuII (682, 10.797), BsmBI (2.394, 2.728), AarI (2.432, 8.848).
Sem sítio: SalI, SphI, SpeI, MluI, PacI, SbfI, PmeI, SwaI, HpaI, BsrGI, SacII, AatII.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 1
- UbiZm
- Promotor 2
- Act
- Tamanho
- 12.628 bp, circular
- Data do registro
- 18-MAR-2022
Construção
- PU6C4 (sem scaffold anotado) · cassete de gRNA, 10.041–10.493
Ligation of ActmutAscBsp* into E752p7D35s-ZmUbi-Cpf1-Os4*
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| 'LacZ | Sequência codificadora CDS | 604 | 825 | 222 | − |
| LIR | Outro misc_feature | 847 | 1.198 | 352 | + |
| SIR | Outro misc_feature | 1.226 | 1.382 | 157 | + |
| LIR | Outro misc_feature | 1.383 | 1.734 | 352 | + |
| pAct | Promotor misc_feature | 1.743 | 3.140 | 1.398 | + |
| mut | Sítio misc_feature | 2.732 | 2.732 | 1 | + |
| mut to CCGAA | Sítio misc_feature | 3.155 | 3.159 | 5 | + |
| repA | Origem / backbone CDS | 3.160 | 3.750 | 591 | + |
| int | Sítio misc_feature | 3.751 | 3.836 | 86 | + |
| repA | Origem / backbone CDS | 3.837 | 4.250 | 414 | + |
| T35 | Outro misc_feature | 4.257 | 4.458 | 202 | + |
| Ubi-int'' | Sequência codificadora CDS | 4.467 | 5.974 | 1.508 | + |
| Intron' | Sítio misc_feature | 5.454 | 5.973 | 520 | + |
| Kozak | Sítio misc_feature | 5.985 | 5.989 | 5 | + |
| ORF-1 | Sequência codificadora CDS | 5.990 | 9.772 | 3.783 | + |
| NLS | Sítio CDS | 5.996 | 6.016 | 21 | + |
| NLS | Sequência codificadora CDS | 9.722 | 9.769 | 48 | + |
| NOS-T | Terminador misc_feature | 9.778 | 10.031 | 254 | + |
| PU6C4 | Promotor misc_feature | 10.041 | 10.493 | 453 | + |
| DR | Sítio CDS | 10.494 | 10.515 | 22 | + |
| stop | Sítio CDS | 10.542 | 10.548 | 7 | + |
| LacZ' | Sequência codificadora CDS | 10.561 | 10.636 | 76 | − |
| ColE1 | Origem / backbone CDS | 11.034 | 11.750 | 717 | − |
| Amp | Sítio misc_feature | 11.793 | 25 | 0 | − |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
pHC-ZmUbi-Act (E843; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pHC-ZmUbi-Act)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.