pUbiZm-LRFPi B648
Vetor de clonagem pUC com UbiZm–Link-RFP, para monocotiledôneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 77 | entre ColE1 e UbiZm |
| NotIGC^GGCCGC | 93 | entre ColE1 e UbiZm |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 93 | entre ColE1 e UbiZm |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 805 | em UbiZm |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 1.225 | em int |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 1.338 | em int |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 1.383 | em int |
| SpeIA^CTAGT | 1.615 | entre UbiZm e link |
| BamHIG^GATCC | 1.622 | entre UbiZm e link |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1.630 | entre UbiZm e link |
| EcoRIG^AATTC | 1.640 | entre UbiZm e link |
| HindIIIA^AGCTT | 1.646 | entre UbiZm e link |
| MluIA^CGCGT | 1.652 | entre UbiZm e link |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 1.658 | entre UbiZm e link |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 2.287 | em TagRFP |
| BbsI (BpiI)GAAGAC(2/6) | 2.327 | em TagRFP |
| SalIG^TCGAC | 2.618 | entre TagRFP e Tocs |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 2.638 | em Tocs |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2.826 | entre Tocs e Amp |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2.828 | entre Tocs e Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2.855 | entre Tocs e Amp |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 3.821 | em Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 5.426 | entre ColE1 e UbiZm |
Corte duplo: NcoI (87, 1.152), BglII (1.052, 2.838), ApaI (1.165, 2.849), SfiI (92, 2.832), MfeI (339, 1.965), PvuII (2.976, 5.489).
Sem sítio: SphI, EcoRV, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, BstBI, SacII, AatII, BstEII, AarI.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 2
- UbiZm
- Gene 2
- Link-RFP
- Características
- monocotiledôneas
- Outros marcadores
- Amp
- Tamanho
- 5.634 bp, circular
- Data do registro
- 08-FEB-2016
Construção
- UbiZm–TagRFP · Tocs · cassete com inserto, 106–2.818
- MCS · 7 sítios únicos · em 1.615, 1.658
- SfiI ×2 · flanqueia o cassete UbiZm–TagRFP · em 92, 2.832
Ligation of RFPi* into B633pUbiZm-LGFP*
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| UbiZm | Promotor misc_feature | 106 | 1.614 | 1.509 | + |
| int | Sítio misc_feature | 1.093 | 1.612 | 520 | + |
| link | Outro misc_feature | 1.664 | 1.714 | 51 | + |
| TagRFP' | Sequência codificadora CDS | 1.715 | 1.860 | 146 | + |
| int | Sítio CDS | 1.861 | 2.047 | 187 | + |
| 'TagRFP | Sequência codificadora CDS | 2.048 | 2.617 | 570 | + |
| Tocs | Terminador misc_feature | 2.623 | 2.818 | 196 | + |
| Amp | Marcador de seleção misc_feature | 3.634 | 4.494 | 861 | + |
| ColE1 | Origem / backbone CDS | 4.537 | 5.253 | 717 | + |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
pUbiZm-LRFPi (B648; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pUbiZm-LRFPi)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.