pUbiZm-YFP C260
Vetor de clonagem pUC com UbiZm–mCitrine, para monocotiledôneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 77 | entre ColE1 e pUbi |
| NotIGC^GGCCGC | 93 | entre ColE1 e pUbi |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 93 | entre ColE1 e pUbi |
| SpeIA^CTAGT | 100 | entre ColE1 e pUbi |
| BamHIG^GATCC | 106 | entre ColE1 e pUbi |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 114 | entre ColE1 e pUbi |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 354 | em pUbi |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 820 | em pUbi |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 1.240 | em Int |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 1.398 | em Int |
| PstICTGCA^G | 1.626 | em Int |
| HindIIIA^AGCTT | 1.632 | entre pUbi e YFP |
| MluIA^CGCGT | 1.638 | entre pUbi e YFP |
| SalIG^TCGAC | 2.378 | entre YFP e OCS |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 2.398 | em OCS |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2.586 | entre OCS e Amp |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2.588 | entre OCS e Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2.615 | entre OCS e Amp |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 3.581 | em Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 4.115 | em Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 5.186 | entre ColE1 e pUbi |
Corte duplo: NcoI (87, 1.167), BglII (1.067, 2.598), ClaI (1.353, 2.040), ApaI (1.180, 2.609), SfiI (92, 2.592), PvuII (2.736, 5.249).
Sem sítio: EcoRI, SphI, EcoRV, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, BstBI, HpaI, BsrGI, SacII, AatII, BstEII, BbsI, AarI.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 2
- UbiZm
- Gene 2
- mCitrine
- Características
- monocotiledôneas
- Outros marcadores
- Amp
- Tamanho
- 5.394 bp, circular
- Data do registro
- 04-OCT-2017
Construção
- pUbi–YFP · OCS · cassete com inserto, 122–2.578
- MCS · 6 sítios únicos · em 77, 114
- SfiI ×2 · flanqueia o cassete pUbi–YFP · em 92, 2.592
Ligation of YFPoi* into B595pUbiZm-mGFPM-ocs*
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| pUbi | Promotor misc_feature | 122 | 1.629 | 1.508 | + |
| Int | Sítio misc_feature | 1.108 | 1.627 | 520 | + |
| YFP | Sequência codificadora CDS | 1.655 | 2.374 | 720 | + |
| OCS | Terminador misc_feature | 2.383 | 2.578 | 196 | + |
| Amp | Marcador de seleção misc_feature | 3.394 | 4.254 | 861 | + |
| ColE1 | Origem / backbone CDS | 4.297 | 5.013 | 717 | + |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
pUbiZm-YFP (C260; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pUbiZm-YFP)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.