p75-GusRNAi
Vetor de RNAi com 35S–bar e 35S–Gus-spacer-Gus.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 1 | entre BL e 35S |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 425 | entre 35S e pat |
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 873 | em pat |
| PvuIICAG^CTG | 933 | em pat |
| PstICTGCA^G | 1.220 | entre T35S e LoxP |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 1.220 | entre T35S e LoxP |
| PacITTAAT^TAA | 1.261 | entre T35S e LoxP |
| SpeIA^CTAGT | 1.735 | entre 35S-Pro e GUS-sense |
| BamHIG^GATCC | 2.288 | entre GUS-sense e Spacer-GUS |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 2.573 | em Spacer-GUS |
| EcoRIG^AATTC | 3.335 | entre Spacer-GUS e GUS-AS |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 3.895 | entre GUS-AS e NOS-T |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 3.933 | em NOS-T |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 4.024 | em NOS-T |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 4.199 | entre LoxP e BR |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 4.266 | entre LoxP e BR |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 4.657 | entre BR e ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 8.871 | em pVS1 ORI |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 8.987 | em pVS1 ORI |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 9.067 | em pVS1 ORI |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 10.352 | em Sm/Sp |
Corte duplo: SalI (702, 3.898), NcoI (437, 4.210), NdeI (5.772, 7.531), BglII (983, 4.218), SfiI (1.251, 4.212), FseI (6.538, 8.643), AgeI (9.481, 9.789), BsrGI (2.600, 3.026), XmnI (292, 1.602), BsaI (9.390, 9.810), SapI (5.710, 9.607), AarI (773, 2.812).
Sem sítio: HindIII, SmaI, AscI, AvrII, HpaI, StuI.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 1
- 35S
- Gene 1
- bar
- Promotor 2
- 35S
- Gene 2
- Gus-spacer-Gus
- Características
- construção hairpin com espaçador, para RNAi
- Outros marcadores
- pat, Sm/Sp
- Tamanho
- 11.808 bp, circular
- Data do registro
- 07-JAN-2002
Construção
- 35S–pat · T35S · cassete de seleção, 7–1.213
- 35S-Pro–(vazio)–Spacer-GUS · cassete de expressão vazio, 1.313–3.291
- SfiI ×2 · flanqueia o cassete 35S-Pro–(empty)–Spacer-GUS · em 1.251, 4.212
Ligation of 35GusRNAi into pLH7500
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| 35S | Promotor misc_feature | 7 | 422 | 416 | + |
| pat | Marcador de seleção misc_feature | 439 | 990 | 552 | + |
| T35S | Terminador misc_feature | 1.013 | 1.213 | 201 | + |
| LoxP | Sítio misc_feature | 1.264 | 1.297 | 34 | + |
| 35S-Pro | Promotor misc_feature | 1.313 | 1.731 | 419 | + |
| GUS-sense | Outro misc_feature | 1.739 | 2.288 | 550 | + |
| Spacer-GUS | Terminador misc_feature | 2.290 | 3.291 | 1.002 | + |
| GUS-AS | Outro misc_feature | 3.339 | 3.890 | 552 | − |
| NOS-T | Terminador misc_feature | 3.904 | 4.157 | 254 | + |
| LoxP | Sítio misc_feature | 4.164 | 4.197 | 34 | + |
| BR | Sítio misc_feature | 4.335 | 4.335 | 1 | + |
| ColE1 | Origem / backbone misc_feature | 4.840 | 5.537 | 698 | + |
| pVS1 ORI | Origem / backbone misc_feature | 6.086 | 9.791 | 3.706 | + |
| Sm/Sp | Marcador de seleção misc_feature | 9.975 | 10.985 | 1.011 | + |
| BL | Sítio misc_feature | 11.520 | 11.520 | 1 | + |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
p75-GusRNAi (DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/rnai/p75-GusRNAi)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.