p9M2x35s F652
Binärer Vektor mit 2x35s–nptII, für Monokotyle.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 163 | zwischen Left Border Region und P2x35s' |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 958 | zwischen P2x35s' und NptIIo |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 1.486 | in NptIIo' |
| PstICTGCA^G | 2.286 | zwischen 'E9 und Right Border Region |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2.286 | zwischen 'E9 und Right Border Region |
| NotIGC^GGCCGC | 2.295 | zwischen 'E9 und Right Border Region |
| SpeIA^CTAGT | 2.305 | zwischen 'E9 und Right Border Region |
| BamHIG^GATCC | 2.314 | zwischen 'E9 und Right Border Region |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 2.325 | zwischen 'E9 und Right Border Region |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 2.332 | zwischen 'E9 und Right Border Region |
| EcoRIG^AATTC | 2.341 | zwischen 'E9 und Right Border Region |
| HindIIIA^AGCTT | 2.350 | zwischen 'E9 und Right Border Region |
| SalIG^TCGAC | 2.359 | zwischen 'E9 und Right Border Region |
| BglIIA^GATCT | 2.379 | zwischen 'E9 und Right Border Region |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2.401 | zwischen 'E9 und Right Border Region |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 2.433 | in Right Border Region |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 2.558 | in Right Border Region |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 2.824 | in Right Border Region |
Schneiden zweimal: EcoRV (826, 2.945), ApaI (1.059, 2.392), SfiI (2.294, 2.373), MfeI (14, 1.379), StuI (2.288, 2.367), EagI (2.295, 2.815), XmnI (461, 786), BstEII (1.728, 6.236), AarI (1.449, 1.570).
Keine Schnittstelle: NcoI, NdeI, NheI, ClaI, MluI, AscI, PacI, FseI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, BstBI, HpaI, NsiI, AflII, SacII, PvuII, BsaI, BsmBI, SapI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 1
- 2x35s
- Gen 1
- nptII
- Merkmale
- Monokotyle
- Weitere Marker
- NptIIo, NptIIo', strep/spec
- Größe
- 7.086 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 15-JUN-2023
Konstrukt
- P2x35s–NptIIo · E9 · Selektionskassette, 174–2.276
- MCS · 13 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 2.286, 2.433
- SfiI ×2 · flankiert die MCS · Pos. 2.294, 2.373
- T-DNA-Grenzen (Borders) · LB, RB
Ligation of NptE9-Xho-Bam* into E760p7M2x35s*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| LB' | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P2x35s' | Promotor misc_feature | 174 | 958 | 785 | + |
| NptIIo | Selektionsmarker CDS | 976 | 1.274 | 299 | + |
| 'intron | Kodierende Sequenz CDS | 1.275 | 1.461 | 187 | + |
| NptIIo' | Selektionsmarker CDS | 1.462 | 1.965 | 504 | + |
| Change to T | Schnittstelle misc_feature | 1.623 | 1.623 | 1 | + |
| ''E9 | Terminator misc_feature | 1.987 | 2.276 | 290 | + |
| Right Border Region | Sonstiges misc_feature | 2.404 | 3.006 | 603 | + |
| RB | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 2.449 | 2.472 | 24 | + |
| 'ColE1'' | Origin / Backbone misc_feature | 3.020 | 3.678 | 659 | + |
| ''pVS1 ORI''' | Origin / Backbone misc_feature | 3.707 | 5.670 | 1.964 | + |
| ParB | Kodierende Sequenz CDS | 4.033 | 5.208 | 1.176 | + |
| strep/spec | Selektionsmarker CDS | 5.859 | 6.869 | 1.011 | + |
| Left Border Region | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 6.937 | 163 | 0 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
p9M2x35s (F652; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9M2x35s; RRID:SCR_029231)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.