pB-UbiAt-DoGusi-ocs D751
Binärer Vektor mit Ubq10–oGus, für Dikotyle.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| NcoIC^CATGG | 311 | zwischen LB und Pro-Ubq10At |
| SpeIA^CTAGT | 324 | zwischen LB und Pro-Ubq10At |
| BamHIG^GATCC | 330 | zwischen LB und Pro-Ubq10At |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 338 | zwischen LB und Pro-Ubq10At |
| EcoRIG^AATTC | 1.002 | in Pro-Ubq10At |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 1.435 | in Pro-Ubq10At |
| HindIIIA^AGCTT | 1.820 | zwischen Pro-Ubq10At und ogus |
| MluIA^CGCGT | 1.826 | zwischen Pro-Ubq10At und ogus |
| AarICACCTGC(4/8) | 2.634 | in Intron |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 2.742 | in ogus |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 4.054 | zwischen OCS und RB |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 4.075 | zwischen OCS und RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 4.081 | zwischen OCS und RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 4.113 | zwischen OCS und RB |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 4.238 | zwischen RB und ColE1 |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 4.504 | zwischen RB und ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 8.718 | in pVS1 ORI |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 8.834 | in pVS1 ORI |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 8.914 | in pVS1 ORI |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 10.199 | in Sm/Sp |
Schneiden zweimal: SalI (1.180, 3.844), NdeI (5.619, 7.378), SfiI (316, 4.058), FseI (6.385, 8.490), MfeI (14, 2.564), AgeI (9.328, 9.636), StuI (3.348, 4.052), XmnI (603, 3.479), BbsI (1.622, 5.914).
Keine Schnittstelle: PstI, XhoI, AscI, PacI, SbfI, SwaI, AvrII, BstBI, NsiI, BsrGI, SacII, PvuII.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 1
- Ubq10
- Gen 1
- oGus
- Merkmale
- Dikotyle
- Weitere Marker
- Sm/Sp
- Größe
- 11.352 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 26-AUG-2020
Konstrukt
- Pro-Ubq10At–ogus · OCS · Kassette mit Insert, 342–4.044
- MCS · 4 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 311, 338
- SfiI ×2 · flankiert die Kassette Pro-Ubq10At–ogus · Pos. 316, 4.058
- T-DNA-Grenzen (Borders) · LB, RB
Ligation of B494pUbiAt-DoGusi-ocs* into pB-BA*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| Pro-Ubq10At | Promotor misc_feature | 342 | 1.817 | 1.476 | + |
| TATA | Schnittstelle misc_feature | 1.413 | 1.416 | 4 | + |
| Ubi cds 5 | Promotor misc_feature | 1.446 | 1.509 | 64 | + |
| íntron | Sonstiges misc_feature | 1.512 | 1.815 | 304 | + |
| ogus | Kodierende Sequenz CDS | 1.843 | 2.457 | 615 | + |
| 'Intron | Schnittstelle misc_feature | 2.458 | 2.646 | 189 | + |
| ogus | Kodierende Sequenz CDS | 2.647 | 3.843 | 1.197 | + |
| OCS | Terminator misc_feature | 3.849 | 4.044 | 196 | + |
| RB | T-DNA-Grenze (Border) misc_feature | 4.129 | 4.152 | 24 | + |
| ColE1 | Origin / Backbone misc_feature | 4.687 | 5.384 | 698 | + |
| BOM | Origin / Backbone misc_feature | 5.421 | 5.680 | 260 | + |
| pVS1 ORI | Origin / Backbone misc_feature | 5.933 | 9.638 | 3.706 | + |
| Sm/Sp | Selektionsmarker misc_feature | 9.822 | 10.832 | 1.011 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
pB-UbiAt-DoGusi-ocs (D751; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/pB-UbiAt-DoGusi-ocs)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.