pB-UbiAt-DoGusi-ocs D751
Vector binario con Ubq10–oGus, para dicotiledóneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| NcoIC^CATGG | 311 | entre LB y Pro-Ubq10At |
| SpeIA^CTAGT | 324 | entre LB y Pro-Ubq10At |
| BamHIG^GATCC | 330 | entre LB y Pro-Ubq10At |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 338 | entre LB y Pro-Ubq10At |
| EcoRIG^AATTC | 1002 | en Pro-Ubq10At |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 1435 | en Pro-Ubq10At |
| HindIIIA^AGCTT | 1820 | entre Pro-Ubq10At y ogus |
| MluIA^CGCGT | 1826 | entre Pro-Ubq10At y ogus |
| AarICACCTGC(4/8) | 2634 | en Intron |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 2742 | en ogus |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 4054 | entre OCS y RB |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 4075 | entre OCS y RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 4081 | entre OCS y RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 4113 | entre OCS y RB |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 4238 | entre RB y ColE1 |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 4504 | entre RB y ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 8718 | en pVS1 ORI |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 8834 | en pVS1 ORI |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 8914 | en pVS1 ORI |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 10.199 | en Sm/Sp |
Corte doble: SalI (1180, 3844), NdeI (5619, 7378), SfiI (316, 4058), FseI (6385, 8490), MfeI (14, 2564), AgeI (9328, 9636), StuI (3348, 4052), XmnI (603, 3479), BbsI (1622, 5914).
Sin sitio: PstI, XhoI, AscI, PacI, SbfI, SwaI, AvrII, BstBI, NsiI, BsrGI, SacII, PvuII.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 1
- Ubq10
- Gen 1
- oGus
- Características
- dicotiledóneas
- Otros marcadores
- Sm/Sp
- Tamaño
- 11.352 bp, circular
- Fecha del registro
- 26-AUG-2020
Construcción
- Pro-Ubq10At–ogus · OCS · casete con inserto, 342–4044
- MCS · 4 sitios únicos · en 311, 338
- SfiI ×2 · flanquea el casete Pro-Ubq10At–ogus · en 316, 4058
- Bordes del T-DNA · LB, RB
Ligation of B494pUbiAt-DoGusi-ocs* into pB-BA*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Borde del T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| Pro-Ubq10At | Promotor misc_feature | 342 | 1817 | 1476 | + |
| TATA | Sitio misc_feature | 1413 | 1416 | 4 | + |
| Ubi cds 5 | Promotor misc_feature | 1446 | 1509 | 64 | + |
| íntron | Otro misc_feature | 1512 | 1815 | 304 | + |
| ogus | Secuencia codificante CDS | 1843 | 2457 | 615 | + |
| 'Intron | Sitio misc_feature | 2458 | 2646 | 189 | + |
| ogus | Secuencia codificante CDS | 2647 | 3843 | 1197 | + |
| OCS | Terminador misc_feature | 3849 | 4044 | 196 | + |
| RB | Borde del T-DNA misc_feature | 4129 | 4152 | 24 | + |
| ColE1 | Origen / backbone misc_feature | 4687 | 5384 | 698 | + |
| BOM | Origen / backbone misc_feature | 5421 | 5680 | 260 | + |
| pVS1 ORI | Origen / backbone misc_feature | 5933 | 9638 | 3706 | + |
| Sm/Sp | Marcador de selección misc_feature | 9822 | 10.832 | 1011 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
pB-UbiAt-DoGusi-ocs (D751; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/pB-UbiAt-DoGusi-ocs)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.