pUC und E.-coli-Expression · Mehrere Expressionskassetten
pBA-2xUbiZm F515
pUC-Klonierungsvektor.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2 | zwischen Amp'' und Ubi-int |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 18 | zwischen Amp'' und Ubi-int |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 25 | zwischen Amp'' und Ubi-int |
| AscI (SgsI)GG^CGCGCC | 1.558 | zwischen Ubi-int und Thsp17 |
| AvrII (XmaJI)C^CTAGG | 3.313 | zwischen Ubi-int und NOS-T |
| MluIA^CGCGT | 3.321 | zwischen Ubi-int und NOS-T |
| SalIG^TCGAC | 3.329 | zwischen Ubi-int und NOS-T |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 3.376 | in NOS-T |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 3.611 | zwischen NOS-T und ColE1'' |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3.618 | zwischen NOS-T und ColE1'' |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 3.625 | zwischen NOS-T und ColE1'' |
| NotIGC^GGCCGC | 3.629 | zwischen NOS-T und ColE1'' |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 3.629 | zwischen NOS-T und ColE1'' |
| PacITTAAT^TAA | 3.641 | zwischen NOS-T und ColE1'' |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 4.490 | in Amp'' |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 5.028 | in Amp'' |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 5.236 | zwischen Amp'' und Ubi-int |
Schneiden zweimal: PstI (1.535, 3.306), XhoI (729, 2.500), NcoI (1.076, 2.847), NheI (1.149, 2.920), BglII (976, 2.747), ClaI (1.262, 3.033), ApaI (1.089, 2.860), SfiI (8, 3.652), MfeI (263, 2.034).
Keine Schnittstelle: EcoRI, BamHI, HindIII, SacI, SmaI, SpeI, SbfI, FseI, PmeI, AgeI, BstBI, HpaI, BsrGI, SacII, PvuII, BstEII, BbsI, BsmBI, SapI, AarI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 1
- UbiZm
- Weitere Marker
- Amp''
- Größe
- 5.270 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 10-MAR-2023
Konstrukt
- Ubi-int–(leer)–Thsp17 · leere Expressionskassette, 31–1.772
- Ubi-int–(leer)–NOS-T · leere Expressionskassette, 1.802–3.600
- MCS · 6 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 3.611, 3.641
- SfiI ×2 · flankiert 2 Kassetten · Pos. 8, 3.652
- AscI/PacI · je eine Schnittstelle · Pos. 1.558, 3.641
Ligation of THsp-Nhe-Bsa* into E962pBA-UbiZ-UbiZ*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| 'Ubi-int | Promotor misc_feature | 31 | 1.538 | 1.508 | + |
| Intron | Schnittstelle misc_feature | 1.017 | 1.536 | 520 | + |
| 'Thsp17 | Sonstiges misc_feature | 1.566 | 1.772 | 207 | + |
| 'Ubi-int | Promotor misc_feature | 1.802 | 3.309 | 1.508 | + |
| Intron | Schnittstelle misc_feature | 2.788 | 3.307 | 520 | + |
| NOS-T | Terminator misc_feature | 3.347 | 3.600 | 254 | + |
| ColE1'' | Origin / Backbone misc_feature | 3.689 | 4.353 | 665 | − |
| LC | Schnittstelle misc_feature | 4.131 | 4.131 | 1 | + |
| Amp'' | Selektionsmarker CDS | 4.354 | 5.216 | 863 | − |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
pBA-2xUbiZm (F515; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pBA-2xUbiZm)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.