pUC y expresión en E. coli · Múltiples casetes
pBA-2xUbiZm F515
Vector de clonación pUC.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2 | entre Amp'' y Ubi-int |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 18 | entre Amp'' y Ubi-int |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 25 | entre Amp'' y Ubi-int |
| AscI (SgsI)GG^CGCGCC | 1558 | entre Ubi-int y Thsp17 |
| AvrII (XmaJI)C^CTAGG | 3313 | entre Ubi-int y NOS-T |
| MluIA^CGCGT | 3321 | entre Ubi-int y NOS-T |
| SalIG^TCGAC | 3329 | entre Ubi-int y NOS-T |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 3376 | en NOS-T |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 3611 | entre NOS-T y ColE1'' |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3618 | entre NOS-T y ColE1'' |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 3625 | entre NOS-T y ColE1'' |
| NotIGC^GGCCGC | 3629 | entre NOS-T y ColE1'' |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 3629 | entre NOS-T y ColE1'' |
| PacITTAAT^TAA | 3641 | entre NOS-T y ColE1'' |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 4490 | en Amp'' |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 5028 | en Amp'' |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 5236 | entre Amp'' y Ubi-int |
Corte doble: PstI (1535, 3306), XhoI (729, 2500), NcoI (1076, 2847), NheI (1149, 2920), BglII (976, 2747), ClaI (1262, 3033), ApaI (1089, 2860), SfiI (8, 3652), MfeI (263, 2034).
Sin sitio: EcoRI, BamHI, HindIII, SacI, SmaI, SpeI, SbfI, FseI, PmeI, AgeI, BstBI, HpaI, BsrGI, SacII, PvuII, BstEII, BbsI, BsmBI, SapI, AarI.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 1
- UbiZm
- Otros marcadores
- Amp''
- Tamaño
- 5270 bp, circular
- Fecha del registro
- 10-MAR-2023
Construcción
- Ubi-int–(vacío)–Thsp17 · casete de expresión vacío, 31–1772
- Ubi-int–(vacío)–NOS-T · casete de expresión vacío, 1802–3600
- MCS · 6 sitios únicos · en 3611, 3641
- SfiI ×2 · flanquea 2 casetes · en 8, 3652
- AscI/PacI · un sitio de cada una · en 1558, 3641
Ligation of THsp-Nhe-Bsa* into E962pBA-UbiZ-UbiZ*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| 'Ubi-int | Promotor misc_feature | 31 | 1538 | 1508 | + |
| Intron | Sitio misc_feature | 1017 | 1536 | 520 | + |
| 'Thsp17 | Otro misc_feature | 1566 | 1772 | 207 | + |
| 'Ubi-int | Promotor misc_feature | 1802 | 3309 | 1508 | + |
| Intron | Sitio misc_feature | 2788 | 3307 | 520 | + |
| NOS-T | Terminador misc_feature | 3347 | 3600 | 254 | + |
| ColE1'' | Origen / backbone misc_feature | 3689 | 4353 | 665 | − |
| LC | Sitio misc_feature | 4131 | 4131 | 1 | + |
| Amp'' | Marcador de selección CDS | 4354 | 5216 | 863 | − |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
pBA-2xUbiZm (F515; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pBA-2xUbiZm; RRID:SCR_029231)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.