pOCS-AM
pUC-Klonierungsvektor.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 5 | zwischen ColE1 und OCS |
| XbaIT^CTAGA | 7 | zwischen ColE1 und OCS |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 17 | zwischen ColE1 und OCS |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 23 | zwischen ColE1 und OCS |
| SpeIA^CTAGT | 28 | zwischen ColE1 und OCS |
| BamHIG^GATCC | 34 | zwischen ColE1 und OCS |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 42 | zwischen ColE1 und OCS |
| PstICTGCA^G | 50 | zwischen ColE1 und OCS |
| EcoRIG^AATTC | 52 | zwischen ColE1 und OCS |
| HindIIIA^AGCTT | 58 | zwischen ColE1 und OCS |
| MluIA^CGCGT | 64 | zwischen ColE1 und OCS |
| SalIG^TCGAC | 70 | zwischen ColE1 und OCS |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 90 | in OCS |
| NotIGC^GGCCGC | 277 | zwischen OCS und Amp |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 277 | zwischen OCS und Amp |
| NcoIC^CATGG | 283 | zwischen OCS und Amp |
| BglIIA^GATCT | 291 | zwischen OCS und Amp |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 301 | zwischen OCS und Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 307 | zwischen OCS und Amp |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 1.273 | in Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 1.807 | in Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 2.878 | zwischen ColE1 und OCS |
Schneiden zweimal: SfiI (20, 285), PvuI (459, 1.504), PvuII (428, 2.941).
Keine Schnittstelle: SphI, XhoI, NdeI, NheI, ClaI, EcoRV, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, MfeI, AgeI, BstBI, HpaI, NsiI, BsrGI, SacII, AatII, BstEII, BbsI, AarI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Gen 2
- MCS
- Merkmale
- Terminatorkassette
- Weitere Marker
- Amp
- Größe
- 3.158 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 25-JUN-2010
Konstrukt
- MCS · 13 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 5, 90
- SfiI ×2 · flankiert die MCS · Pos. 20, 285
Ligation of OCSdummy2* into pAM*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| OCS | Terminator misc_feature | 75 | 270 | 196 | + |
| Amp | Selektionsmarker misc_feature | 1.086 | 1.946 | 861 | + |
| ColE1 | Origin / Backbone CDS | 1.989 | 2.705 | 717 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
pOCS-AM (DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pOCS-AM)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.