pOCS-AM
Vector de clonación pUC.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 5 | entre ColE1 y OCS |
| XbaIT^CTAGA | 7 | entre ColE1 y OCS |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 17 | entre ColE1 y OCS |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 23 | entre ColE1 y OCS |
| SpeIA^CTAGT | 28 | entre ColE1 y OCS |
| BamHIG^GATCC | 34 | entre ColE1 y OCS |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 42 | entre ColE1 y OCS |
| PstICTGCA^G | 50 | entre ColE1 y OCS |
| EcoRIG^AATTC | 52 | entre ColE1 y OCS |
| HindIIIA^AGCTT | 58 | entre ColE1 y OCS |
| MluIA^CGCGT | 64 | entre ColE1 y OCS |
| SalIG^TCGAC | 70 | entre ColE1 y OCS |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 90 | en OCS |
| NotIGC^GGCCGC | 277 | entre OCS y Amp |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 277 | entre OCS y Amp |
| NcoIC^CATGG | 283 | entre OCS y Amp |
| BglIIA^GATCT | 291 | entre OCS y Amp |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 301 | entre OCS y Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 307 | entre OCS y Amp |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 1273 | en Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 1807 | en Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 2878 | entre ColE1 y OCS |
Corte doble: SfiI (20, 285), PvuI (459, 1504), PvuII (428, 2941).
Sin sitio: SphI, XhoI, NdeI, NheI, ClaI, EcoRV, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, MfeI, AgeI, BstBI, HpaI, NsiI, BsrGI, SacII, AatII, BstEII, BbsI, AarI.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Gen 2
- MCS
- Características
- casete de terminador
- Otros marcadores
- Amp
- Tamaño
- 3158 bp, circular
- Fecha del registro
- 25-JUN-2010
Construcción
- MCS · 13 sitios únicos · en 5, 90
- SfiI ×2 · flanquea el MCS · en 20, 285
Ligation of OCSdummy2* into pAM*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| OCS | Terminador misc_feature | 75 | 270 | 196 | + |
| Amp | Marcador de selección misc_feature | 1086 | 1946 | 861 | + |
| ColE1 | Origen / backbone CDS | 1989 | 2705 | 717 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
pOCS-AM (DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pOCS-AM; RRID:SCR_029231)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.