pUC und E.-coli-Expression · Mehrere Expressionskassetten
pU10Tnos-U10Tocs C971
pUC-Klonierungsvektor mit Ubq10–Ocs, für Dikotyle.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| NcoIC^CATGG | 113 | zwischen ColE1 und Pro-Ubq10At |
| NotIGC^GGCCGC | 119 | zwischen ColE1 und Pro-Ubq10At |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 119 | zwischen ColE1 und Pro-Ubq10At |
| SpeIA^CTAGT | 1.602 | zwischen Pro-Ubq10At und NOS-T |
| BamHIG^GATCC | 1.611 | zwischen Pro-Ubq10At und NOS-T |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 1.749 | in NOS-T |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1.890 | zwischen NOS-T und Pro-Ubq10At |
| PstICTGCA^G | 3.384 | zwischen Pro-Ubq10At und OCS |
| HindIIIA^AGCTT | 3.389 | zwischen Pro-Ubq10At und OCS |
| MluIA^CGCGT | 3.398 | zwischen Pro-Ubq10At und OCS |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 3.612 | zwischen OCS und Amp |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 3.635 | zwischen OCS und Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3.641 | zwischen OCS und Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 5.141 | in Amp |
Schneiden zweimal: EcoRI (786, 2.563), SfiI (118, 3.618), AflII (1.658, 3.614), PvuII (3.762, 6.275), BbsI (1.406, 3.183), BsmBI (1.887, 3.424).
Keine Schnittstelle: SphI, XhoI, NdeI, NheI, ClaI, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, MfeI, AgeI, BstBI, HpaI, BsrGI, SacII, AatII, BstEII, AarI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 1
- Ubq10
- Promotor 2
- Ubq10
- Gen 2
- Ocs
- Merkmale
- Dikotyle
- Weitere Marker
- Amp
- Größe
- 6.394 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 26-AUG-2020
Konstrukt
- Pro-Ubq10At–(leer)–NOS-T · leere Expressionskassette, 126–1.882
- Pro-Ubq10At–(leer)–OCS · leere Expressionskassette, 1.903–3.604
- SfiI ×2 · flankiert 2 Kassetten · Pos. 118, 3.618
Ligation of NosU10-Spe-Mlu* into 204pUbiAtmu-ocs*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| Pro-Ubq10At | Promotor misc_feature | 126 | 1.601 | 1.476 | + |
| TATA | Schnittstelle misc_feature | 1.197 | 1.200 | 4 | + |
| Ubi cds 5 | Promotor misc_feature | 1.230 | 1.293 | 64 | + |
| íntron | Sonstiges misc_feature | 1.296 | 1.599 | 304 | + |
| NOS-T | Terminator misc_feature | 1.629 | 1.882 | 254 | + |
| Pro-Ubq10At | Promotor misc_feature | 1.903 | 3.378 | 1.476 | + |
| TATA | Schnittstelle misc_feature | 2.974 | 2.977 | 4 | + |
| Ubi cds 5 | Promotor misc_feature | 3.007 | 3.070 | 64 | + |
| íntron | Sonstiges misc_feature | 3.073 | 3.376 | 304 | + |
| OCS | Terminator misc_feature | 3.409 | 3.604 | 196 | + |
| Amp | Selektionsmarker misc_feature | 4.420 | 5.280 | 861 | + |
| ColE1 | Origin / Backbone misc_feature | 5.323 | 6.039 | 717 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
pU10Tnos-U10Tocs (C971; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pU10Tnos-U10Tocs)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.