pUbi-AB
pUC-Klonierungsvektor.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 5 | zwischen ColE1 und Ubi-int |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 23 | zwischen ColE1 und Ubi-int |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 267 | in Ubi-int |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 733 | in Ubi-int |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 1.153 | in Intron |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 1.266 | in Intron |
| SpeIA^CTAGT | 1.543 | zwischen Ubi-int und Tnos |
| BamHIG^GATCC | 1.549 | zwischen Ubi-int und Tnos |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1.557 | zwischen Ubi-int und Tnos |
| EcoRIG^AATTC | 1.567 | zwischen Ubi-int und Tnos |
| HindIIIA^AGCTT | 1.573 | zwischen Ubi-int und Tnos |
| MluIA^CGCGT | 1.579 | zwischen Ubi-int und Tnos |
| SalIG^TCGAC | 1.585 | zwischen Ubi-int und Tnos |
| NotIGC^GGCCGC | 1.864 | zwischen Tnos und Amp |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 1.864 | zwischen Tnos und Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 1.894 | zwischen Tnos und Amp |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 2.860 | in Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 3.394 | in Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 4.465 | zwischen ColE1 und Ubi-int |
Schneiden zweimal: NcoI (1.080, 1.870), BglII (980, 1.878), ApaI (1.093, 1.888), SfiI (20, 1.872), NsiI (1.311, 1.723), AflII (17, 1.632), PvuII (2.015, 4.528).
Keine Schnittstelle: SphI, EcoRV, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, BstBI, HpaI, BsrGI, SacII, AatII, BstEII, BbsI, BsmBI, AarI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 2
- UbiZm
- Gen 2
- MCS
- Merkmale
- Ubi-maize-Promotorkassette
- Weitere Marker
- Amp
- Größe
- 4.745 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 14-JUL-2010
Konstrukt
- Ubi-int–(leer)–Tnos · leere Expressionskassette, 34–1.856
- MCS · 7 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 1.543, 1.585
- SfiI ×2 · flankiert die Kassette Ubi-int–(empty)–Tnos · Pos. 20, 1.872
pUbi-AB rotated to position 3197
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| Ubi-int | Promotor misc_feature | 34 | 1.542 | 1.509 | + |
| Intron | Schnittstelle misc_feature | 1.021 | 1.540 | 520 | + |
| Tnos | Terminator misc_feature | 1.603 | 1.856 | 254 | + |
| Amp | Selektionsmarker CDS | 2.673 | 3.533 | 861 | + |
| ColE1 | Origin / Backbone misc_feature | 3.576 | 4.292 | 717 | − |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
pUbi-AB (DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pUbi-AB; RRID:SCR_029231)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.
Verwendet in
- Comparative analysis of stress-induced calcium signals in the crop species barley and the model plant Arabidopsis thaliana – Giridhar M, Meier B, Imani J, et al., BMC Plant Biology 2022; 22:447
- Overexpression of HvIcy6 in Barley Enhances Resistance against Tetranychus urticae and Entails Partial Transcriptomic Reprogramming – Santamaria M, Diaz-Mendoza M, Perez-Herguedas D, et al., International Journal of Molecular Sciences 2018; 19:697
- The Piriformospora indica effector PIIN_08944 promotes the mutualistic Sebacinalean symbiosis – Akum FN, Steinbrenner J, Biedenkopf D, et al., Frontiers in Plant Science 2015; 6