pUbi-AB
Vector de clonación pUC.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 5 | entre ColE1 y Ubi-int |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 23 | entre ColE1 y Ubi-int |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 267 | en Ubi-int |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 733 | en Ubi-int |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 1153 | en Intron |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 1266 | en Intron |
| SpeIA^CTAGT | 1543 | entre Ubi-int y Tnos |
| BamHIG^GATCC | 1549 | entre Ubi-int y Tnos |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1557 | entre Ubi-int y Tnos |
| EcoRIG^AATTC | 1567 | entre Ubi-int y Tnos |
| HindIIIA^AGCTT | 1573 | entre Ubi-int y Tnos |
| MluIA^CGCGT | 1579 | entre Ubi-int y Tnos |
| SalIG^TCGAC | 1585 | entre Ubi-int y Tnos |
| NotIGC^GGCCGC | 1864 | entre Tnos y Amp |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 1864 | entre Tnos y Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 1894 | entre Tnos y Amp |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 2860 | en Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 3394 | en Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 4465 | entre ColE1 y Ubi-int |
Corte doble: NcoI (1080, 1870), BglII (980, 1878), ApaI (1093, 1888), SfiI (20, 1872), NsiI (1311, 1723), AflII (17, 1632), PvuII (2015, 4528).
Sin sitio: SphI, EcoRV, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, BstBI, HpaI, BsrGI, SacII, AatII, BstEII, BbsI, BsmBI, AarI.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 2
- UbiZm
- Gen 2
- MCS
- Características
- casete con promotor Ubi-maize
- Otros marcadores
- Amp
- Tamaño
- 4745 bp, circular
- Fecha del registro
- 14-JUL-2010
Construcción
- Ubi-int–(vacío)–Tnos · casete de expresión vacío, 34–1856
- MCS · 7 sitios únicos · en 1543, 1585
- SfiI ×2 · flanquea el casete Ubi-int–(empty)–Tnos · en 20, 1872
pUbi-AB rotated to position 3197
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| Ubi-int | Promotor misc_feature | 34 | 1542 | 1509 | + |
| Intron | Sitio misc_feature | 1021 | 1540 | 520 | + |
| Tnos | Terminador misc_feature | 1603 | 1856 | 254 | + |
| Amp | Marcador de selección CDS | 2673 | 3533 | 861 | + |
| ColE1 | Origen / backbone misc_feature | 3576 | 4292 | 717 | − |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
pUbi-AB (DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pUbi-AB)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.
Utilizado en
- Comparative analysis of stress-induced calcium signals in the crop species barley and the model plant Arabidopsis thaliana – Giridhar M, Meier B, Imani J, et al., BMC Plant Biology 2022; 22:447
- Overexpression of HvIcy6 in Barley Enhances Resistance against Tetranychus urticae and Entails Partial Transcriptomic Reprogramming – Santamaria M, Diaz-Mendoza M, Perez-Herguedas D, et al., International Journal of Molecular Sciences 2018; 19:697
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