pet28-MBP-CBE-nC9-His F576
E.-coli-Expressionsvektor mit CBE.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 66 | zwischen lac\operator und MBP |
| NcoIC^CATGG | 105 | zwischen lac\operator und MBP |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 233 | in MBP |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 460 | in MBP |
| SalIG^TCGAC | 1.353 | in ORF-1 |
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 1.717 | in GAM |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 2.684 | in SGGS Linker' |
| BamHIG^GATCC | 2.726 | in ORF-1 |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 3.249 | in nCas9' |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 3.827 | zwischen ORF-1 und 'nCas9 |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 6.854 | zwischen ORF-1 und ORF1 |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 8.085 | in kan\sequence |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 8.266 | in kan\sequence |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 9.274 | zwischen kan\sequence und lac\I |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 11.055 | in lac\I |
Schneiden zweimal: HindIII (3.735, 6.080), SphI (3.989, 11.791), KpnI (1.926, 4.506), BglII (529, 11.980), MluI (5.300, 11.258), BstBI (1.884, 4.066), NsiI (7.847, 8.113), PvuI (495, 7.961).
Keine Schnittstelle: NotI, SpeI, AscI, PacI, SfiI, SbfI, FseI, PmeI, AvrII, AgeI, StuI, AflII, BsrGI, EagI, AarI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Gen 2
- CBE
- Weitere Marker
- kan\sequence
- Größe
- 11.980 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 01-JUN-2023
Konstrukt
- T7 promoter–MBP–ORF-1–GamApo_String1–GAM–APOBEC1–GamApo_String2–nCas9 · Kassette mit Insert, 20–6.832
Ligation of Cas9-His* into F350pet28-MBP-CBE-nC9*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| T7 promoter | Schnittstelle CDS | 20 | 37 | 18 | + |
| lac\operator | Schnittstelle CDS | 36 | 66 | 31 | + |
| MBP | Kodierende Sequenz CDS | 107 | 1.353 | 1.247 | + |
| ORF-1 | Kodierende Sequenz CDS | 107 | 3.827 | 3.721 | + |
| 6xHis affinity tag | Schnittstelle CDS | 119 | 136 | 18 | + |
| thrombin recognition and cleavage site | Schnittstelle CDS | 146 | 163 | 18 | + |
| 'GamApo_String1 | Kodierende Sequenz CDS | 1.354 | 2.054 | 701 | + |
| TEV | Schnittstelle misc_feature | 1.361 | 1.381 | 21 | + |
| GAM | Kodierende Sequenz CDS | 1.382 | 1.952 | 571 | + |
| APOBEC1 | Kodierende Sequenz CDS | 1.953 | 2.636 | 684 | + |
| GamApo_String2 | Kodierende Sequenz CDS | 2.025 | 2.726 | 702 | + |
| SGGS Linker' | Kodierende Sequenz CDS | 2.636 | 2.726 | 91 | + |
| nCas9' | Kodierende Sequenz CDS | 2.733 | 3.827 | 1.095 | + |
| D10A | Schnittstelle misc_feature | 2.756 | 2.758 | 3 | + |
| ''nCas9 | Kodierende Sequenz CDS | 3.828 | 6.831 | 3.004 | + |
| ORF-1 | Kodierende Sequenz CDS | 3.828 | 6.832 | 3.005 | + |
| 'ORF1 | Schnittstelle CDS | 6.855 | 6.880 | 26 | + |
| His-Tag | Schnittstelle CDS | 6.860 | 6.877 | 18 | + |
| Stop | Schnittstelle CDS | 6.878 | 6.880 | 3 | + |
| kan\sequence | Selektionsmarker CDS | 7.579 | 8.391 | 813 | − |
| lac\I | Kodierende Sequenz CDS | 10.534 | 11.613 | 1.080 | − |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
pet28-MBP-CBE-nC9-His (F576; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pet28-MBP-CBE-nC9-His)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.