pet28-MBP-CBE-nC9-His F576
Vetor de expressão em E. coli com CBE.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 66 | entre lac\operator e MBP |
| NcoIC^CATGG | 105 | entre lac\operator e MBP |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 233 | em MBP |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 460 | em MBP |
| SalIG^TCGAC | 1.353 | em ORF-1 |
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 1.717 | em GAM |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 2.684 | em SGGS Linker' |
| BamHIG^GATCC | 2.726 | em ORF-1 |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 3.249 | em nCas9' |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 3.827 | entre ORF-1 e 'nCas9 |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 6.854 | entre ORF-1 e ORF1 |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 8.085 | em kan\sequence |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 8.266 | em kan\sequence |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 9.274 | entre kan\sequence e lac\I |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 11.055 | em lac\I |
Corte duplo: HindIII (3.735, 6.080), SphI (3.989, 11.791), KpnI (1.926, 4.506), BglII (529, 11.980), MluI (5.300, 11.258), BstBI (1.884, 4.066), NsiI (7.847, 8.113), PvuI (495, 7.961).
Sem sítio: NotI, SpeI, AscI, PacI, SfiI, SbfI, FseI, PmeI, AvrII, AgeI, StuI, AflII, BsrGI, EagI, AarI.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Gene 2
- CBE
- Outros marcadores
- kan\sequence
- Tamanho
- 11.980 bp, circular
- Data do registro
- 01-JUN-2023
Construção
- T7 promoter–MBP–ORF-1–GamApo_String1–GAM–APOBEC1–GamApo_String2–nCas9 · cassete com inserto, 20–6.832
Ligation of Cas9-His* into F350pet28-MBP-CBE-nC9*
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| T7 promoter | Sítio CDS | 20 | 37 | 18 | + |
| lac\operator | Sítio CDS | 36 | 66 | 31 | + |
| MBP | Sequência codificadora CDS | 107 | 1.353 | 1.247 | + |
| ORF-1 | Sequência codificadora CDS | 107 | 3.827 | 3.721 | + |
| 6xHis affinity tag | Sítio CDS | 119 | 136 | 18 | + |
| thrombin recognition and cleavage site | Sítio CDS | 146 | 163 | 18 | + |
| 'GamApo_String1 | Sequência codificadora CDS | 1.354 | 2.054 | 701 | + |
| TEV | Sítio misc_feature | 1.361 | 1.381 | 21 | + |
| GAM | Sequência codificadora CDS | 1.382 | 1.952 | 571 | + |
| APOBEC1 | Sequência codificadora CDS | 1.953 | 2.636 | 684 | + |
| GamApo_String2 | Sequência codificadora CDS | 2.025 | 2.726 | 702 | + |
| SGGS Linker' | Sequência codificadora CDS | 2.636 | 2.726 | 91 | + |
| nCas9' | Sequência codificadora CDS | 2.733 | 3.827 | 1.095 | + |
| D10A | Sítio misc_feature | 2.756 | 2.758 | 3 | + |
| ''nCas9 | Sequência codificadora CDS | 3.828 | 6.831 | 3.004 | + |
| ORF-1 | Sequência codificadora CDS | 3.828 | 6.832 | 3.005 | + |
| 'ORF1 | Sítio CDS | 6.855 | 6.880 | 26 | + |
| His-Tag | Sítio CDS | 6.860 | 6.877 | 18 | + |
| Stop | Sítio CDS | 6.878 | 6.880 | 3 | + |
| kan\sequence | Marcador de seleção CDS | 7.579 | 8.391 | 813 | − |
| lac\I | Sequência codificadora CDS | 10.534 | 11.613 | 1.080 | − |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
pet28-MBP-CBE-nC9-His (F576; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pet28-MBP-CBE-nC9-His)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.