p5oAct-UbiZm-LH B622
Vector binario con Act–EPSPS, para monocotiledóneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| AarICACCTGC(4/8) | 1002 | en ACT |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 1212 | en ACT |
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 3140 | en epsps |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 3814 | entre TE9 y UbiZm |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 3855 | entre TE9 y UbiZm |
| SpeIA^CTAGT | 5376 | entre UbiZm y Tnos |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 5390 | entre UbiZm y Tnos |
| HindIIIA^AGCTT | 5406 | entre UbiZm y Tnos |
| SalIG^TCGAC | 5418 | entre UbiZm y Tnos |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 5465 | en Tnos |
| PacITTAAT^TAA | 5730 | entre Tnos y RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 5796 | entre Tnos y RB |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 6308 | entre RB y ColE1 |
Corte doble: EcoRI (691, 5400), BamHI (1408, 5382), KpnI (5707, 5764), XhoI (1720, 4566), NcoI (3840, 4913), ClaI (5099, 10.597), ApaI (4926, 5758), MluI (3504, 5412), SfiI (3845, 5741), BsiWI (3862, 10.401), AgeI (11.011, 11.319), AatII (5714, 6187), BstEII (1245, 11.882), BbsI (1982, 7597), SapI (7240, 11.137).
Sin sitio: AscI, AvrII, BstBI, HpaI, StuI, BsrGI, PvuII, XmnI.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 1
- Act
- Gen 1
- EPSPS
- Promotor 2
- UbiZm
- Gen 2
- MCS
- Características
- monocotiledóneas
- Otros marcadores
- Sm/Sp
- Tamaño
- 13.035 bp, circular
- Fecha del registro
- 22-JAN-2016
Construcción
- ACT–cpt–EPSPS · TE9 · casete con inserto, 313–3804
- UbiZm–(vacío)–Tnos · casete de expresión vacío, 3868–5689
- MCS · 5 sitios únicos · en 5376, 5465
- SfiI ×2 · flanquea el casete UbiZm–(empty)–Tnos · en 3845, 5741
- Bordes del T-DNA · LB, RB
Ligation of 594pUbi-BA* into B621p5oAct-LH2*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Borde del T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| ACT | Promotor misc_feature | 313 | 1710 | 1398 | + |
| cpt | Secuencia codificante CDS | 1738 | 1950 | 213 | + |
| EPSPS | Secuencia codificante CDS | 1951 | 2472 | 522 | + |
| int | Sitio misc_feature | 2473 | 2661 | 189 | + |
| epsps | Secuencia codificante CDS | 2662 | 3504 | 843 | + |
| TE9 | Terminador misc_feature | 3514 | 3804 | 291 | + |
| UbiZm | Promotor misc_feature | 3868 | 5375 | 1508 | + |
| int | Sitio misc_feature | 4854 | 5373 | 520 | + |
| Tnos | Terminador misc_feature | 5436 | 5689 | 254 | + |
| RB | Borde del T-DNA misc_feature | 5812 | 5835 | 24 | + |
| ColE1 | Origen / backbone misc_feature | 6370 | 7067 | 698 | + |
| pVS1 | Origen / backbone misc_feature | 7616 | 11.321 | 3706 | + |
| Sm/Sp | Marcador de selección CDS | 11.505 | 12.515 | 1011 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
p5oAct-UbiZm-LH (B622; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p5oAct-UbiZm-LH; RRID:SCR_029231)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.