p5oAct-UbiZm-LH B622
Vecteur binaire avec Act–EPSPS, pour les monocotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| AarICACCTGC(4/8) | 1 002 | dans ACT |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 1 212 | dans ACT |
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 3 140 | dans epsps |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 3 814 | entre TE9 et UbiZm |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 3 855 | entre TE9 et UbiZm |
| SpeIA^CTAGT | 5 376 | entre UbiZm et Tnos |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 5 390 | entre UbiZm et Tnos |
| HindIIIA^AGCTT | 5 406 | entre UbiZm et Tnos |
| SalIG^TCGAC | 5 418 | entre UbiZm et Tnos |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 5 465 | dans Tnos |
| PacITTAAT^TAA | 5 730 | entre Tnos et RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 5 796 | entre Tnos et RB |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 6 308 | entre RB et ColE1 |
Double coupure : EcoRI (691, 5 400), BamHI (1 408, 5 382), KpnI (5 707, 5 764), XhoI (1 720, 4 566), NcoI (3 840, 4 913), ClaI (5 099, 10 597), ApaI (4 926, 5 758), MluI (3 504, 5 412), SfiI (3 845, 5 741), BsiWI (3 862, 10 401), AgeI (11 011, 11 319), AatII (5 714, 6 187), BstEII (1 245, 11 882), BbsI (1 982, 7 597), SapI (7 240, 11 137).
Aucun site : AscI, AvrII, BstBI, HpaI, StuI, BsrGI, PvuII, XmnI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- Act
- Gène 1
- EPSPS
- Promoteur 2
- UbiZm
- Gène 2
- MCS
- Caractéristiques
- monocotylédones
- Autres marqueurs
- Sm/Sp
- Taille
- 13 035 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 22-JAN-2016
Construction
- ACT–cpt–EPSPS · TE9 · cassette avec insert, 313–3 804
- UbiZm–(vide)–Tnos · cassette d’expression vide, 3 868–5 689
- MCS · 5 sites uniques · en 5 376, 5 465
- SfiI ×2 · encadre la cassette UbiZm–(empty)–Tnos · en 3 845, 5 741
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of 594pUbi-BA* into B621p5oAct-LH2*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| ACT | Promoteur misc_feature | 313 | 1 710 | 1 398 | + |
| cpt | Séquence codante CDS | 1 738 | 1 950 | 213 | + |
| EPSPS | Séquence codante CDS | 1 951 | 2 472 | 522 | + |
| int | Site misc_feature | 2 473 | 2 661 | 189 | + |
| epsps | Séquence codante CDS | 2 662 | 3 504 | 843 | + |
| TE9 | Terminateur misc_feature | 3 514 | 3 804 | 291 | + |
| UbiZm | Promoteur misc_feature | 3 868 | 5 375 | 1 508 | + |
| int | Site misc_feature | 4 854 | 5 373 | 520 | + |
| Tnos | Terminateur misc_feature | 5 436 | 5 689 | 254 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 5 812 | 5 835 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 6 370 | 7 067 | 698 | + |
| pVS1 | Origine / squelette misc_feature | 7 616 | 11 321 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 11 505 | 12 515 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p5oAct-UbiZm-LH (B622; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p5oAct-UbiZm-LH)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.