p6D35s-GusiX2 G103
Vector binario con 35s–hptII y oGus, para dicotiledóneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 163 | entre Left Border Region y 35S |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 587 | entre 35S y Kozak |
| MluIA^CGCGT | 1820 | entre hptII'' y E9 |
| PstICTGCA^G | 2130 | entre E9 y GusX''' |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2130 | entre E9 y GusX''' |
| NotIGC^GGCCGC | 2139 | entre E9 y GusX''' |
| SpeIA^CTAGT | 2149 | entre E9 y GusX''' |
| BamHIG^GATCC | 2158 | entre E9 y GusX''' |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 2167 | entre E9 y GusX''' |
| EcoRIG^AATTC | 2176 | entre E9 y GusX''' |
| AgeI (BshTI)A^CCGGT | 2202 | en GusX''' |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 2221 | en GusX''' |
| HindIIIA^AGCTT | 2233 | en GusX''' |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 2490 | en GusX''' |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 2534 | en GusX''' |
| AarICACCTGC(4/8) | 2985 | en 'Intron |
| SalIG^TCGAC | 4195 | entre 'GusX y OCS |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 4215 | en OCS |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 4405 | entre OCS y Right Border Region |
| BglIIA^GATCT | 4415 | entre OCS y Right Border Region |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 4426 | entre OCS y Right Border Region |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 4435 | entre OCS y Right Border Region |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 4467 | en Right Border Region |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 4592 | en Right Border Region |
Corte doble: SfiI (2138, 4409), SacII (975, 1805), PvuI (4802, 8491).
Sin sitio: SacI, NcoI, NdeI, NheI, ClaI, AscI, PacI, FseI, SwaI, AvrII, BsiWI, NsiI, PvuII, SapI.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 1
- 35s
- Gen 1
- hptII
- Gen 2
- oGus
- Características
- dicotiledóneas
- Otros marcadores
- hptII'', strep/spec
- Tamaño
- 9120 bp, circular
- Fecha del registro
- 08-MAR-2024
Construcción
- 35S–hptII · E9 · casete de selección, 169–2120
- MCS · 10 sitios únicos · en 2130, 2233
- SfiI ×2 · flanquea el MCS · en 2138, 4409
- Bordes del T-DNA · LB, RB
Ligation of Gus-Bam-Bst* into F475p6D35s-GusiX*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| LB' | Borde del T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| 35S | Promotor misc_feature | 169 | 584 | 416 | + |
| Kozak | Sitio misc_feature | 600 | 604 | 5 | + |
| hptII | Marcador de selección CDS | 605 | 1174 | 570 | + |
| int | Sitio misc_feature | 1175 | 1363 | 189 | + |
| 'hptII'' | Marcador de selección CDS | 1364 | 1819 | 456 | + |
| 'E9 | Terminador misc_feature | 1830 | 2120 | 291 | + |
| 'GusX''' | Secuencia codificante CDS | 2194 | 2808 | 615 | + |
| ''Intron | Sitio misc_feature | 2809 | 2997 | 189 | + |
| ''GusX | Secuencia codificante CDS | 2998 | 4194 | 1197 | + |
| OCS | Terminador misc_feature | 4200 | 4395 | 196 | + |
| Right Border Region | Otro misc_feature | 4438 | 5040 | 603 | + |
| RB | Borde del T-DNA misc_feature | 4483 | 4506 | 24 | + |
| 'ColE1'' | Origen / backbone misc_feature | 5054 | 5712 | 659 | + |
| ''pVS1 ORI''' | Origen / backbone misc_feature | 5741 | 7704 | 1964 | + |
| ParB | Secuencia codificante CDS | 6067 | 7242 | 1176 | + |
| strep/spec | Marcador de selección CDS | 7893 | 8903 | 1011 | + |
| Left Border Region | Borde del T-DNA misc_feature | 8971 | 163 | 0 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
p6D35s-GusiX2 (G103; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6D35s-GusiX2)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.