p9oU10-oGUS-int B441
Vector binario con Ubq10–nptII y oGus, para dicotiledóneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 1786 | entre UBQ10 y nptIIo |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 3107 | entre TE9 y ogus |
| NcoIC^CATGG | 3133 | entre TE9 y ogus |
| SpeIA^CTAGT | 3146 | entre TE9 y ogus |
| BamHIG^GATCC | 3152 | entre TE9 y ogus |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 3160 | entre TE9 y ogus |
| HindIIIA^AGCTT | 3176 | entre TE9 y ogus |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 4098 | en ogus |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 5410 | entre Tocs y RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 5437 | entre Tocs y RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 5469 | entre Tocs y RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 5860 | entre RB y ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 10.074 | en pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 10.190 | en pVS1 |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 10.270 | en pVS1 |
Corte doble: EcoRI (969, 3170), SalI (1147, 5200), PstI (3107, 3168), SphI (3113, 5594), SacI (1402, 2314), NdeI (6975, 8734), ApaI (1887, 5431), MluI (2797, 3182), SfiI (3138, 5414), AgeI (10.684, 10.992), StuI (4704, 5408), BstEII (2556, 11.555).
Sin sitio: AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, NsiI, BsrGI, SacII, PvuII.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 1
- Ubq10
- Gen 1
- nptII
- Gen 2
- oGus
- Características
- dicotiledóneas
- Otros marcadores
- nptIIo, Sm/Sp
- Tamaño
- 12.708 bp, circular
- Fecha del registro
- 08-FEB-2016
Construcción
- UBQ10–nptIIo · TE9 · casete de selección, 309–3097
- MCS · 6 sitios únicos · en 3107, 3176
- SfiI ×2 · flanquea el MCS · en 3138, 5414
- Bordes del T-DNA · LB, RB
Ligation of B458pDoGusi-ocs* into B435p9oU10-LH*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Borde del T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| UBQ10 | Otro misc_feature | 309 | 1784 | 1476 | + |
| Ubi cds 5 | Promotor misc_feature | 1413 | 1476 | 64 | + |
| int | Sitio misc_feature | 1479 | 1782 | 304 | + |
| nptIIo | Marcador de selección CDS | 1804 | 2102 | 299 | + |
| splice | Sitio misc_signal | 2099 | 2102 | 4 | + |
| int | Sitio CDS | 2103 | 2289 | 187 | + |
| splice | Sitio misc_signal | 2288 | 2291 | 4 | + |
| nptIIo | Marcador de selección CDS | 2290 | 2793 | 504 | + |
| TE9 | Terminador misc_feature | 2807 | 3097 | 291 | + |
| ogus | Secuencia codificante CDS | 3199 | 3813 | 615 | + |
| int | Sitio misc_feature | 3814 | 4002 | 189 | + |
| ogus | Secuencia codificante CDS | 4003 | 5199 | 1197 | + |
| Tocs | Terminador misc_feature | 5205 | 5400 | 196 | + |
| RB | Borde del T-DNA misc_feature | 5485 | 5508 | 24 | + |
| ColE1 | Origen / backbone misc_feature | 6043 | 6740 | 698 | + |
| bom | Origen / backbone misc_feature | 6777 | 7036 | 260 | + |
| pVS1 | Origen / backbone misc_feature | 7289 | 10.994 | 3706 | + |
| Sm/Sp | Marcador de selección CDS | 11.178 | 12.188 | 1011 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
p9oU10-oGUS-int (B441; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9oU10-oGUS-int)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.