p9oU10-oGUS-int B441
Vecteur binaire avec Ubq10–nptII et oGus, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 1 786 | entre UBQ10 et nptIIo |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 3 107 | entre TE9 et ogus |
| NcoIC^CATGG | 3 133 | entre TE9 et ogus |
| SpeIA^CTAGT | 3 146 | entre TE9 et ogus |
| BamHIG^GATCC | 3 152 | entre TE9 et ogus |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 3 160 | entre TE9 et ogus |
| HindIIIA^AGCTT | 3 176 | entre TE9 et ogus |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 4 098 | dans ogus |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 5 410 | entre Tocs et RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 5 437 | entre Tocs et RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 5 469 | entre Tocs et RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 5 860 | entre RB et ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 10 074 | dans pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 10 190 | dans pVS1 |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 10 270 | dans pVS1 |
Double coupure : EcoRI (969, 3 170), SalI (1 147, 5 200), PstI (3 107, 3 168), SphI (3 113, 5 594), SacI (1 402, 2 314), NdeI (6 975, 8 734), ApaI (1 887, 5 431), MluI (2 797, 3 182), SfiI (3 138, 5 414), AgeI (10 684, 10 992), StuI (4 704, 5 408), BstEII (2 556, 11 555).
Aucun site : AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, NsiI, BsrGI, SacII, PvuII.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- Ubq10
- Gène 1
- nptII
- Gène 2
- oGus
- Caractéristiques
- dicotylédones
- Autres marqueurs
- nptIIo, Sm/Sp
- Taille
- 12 708 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 08-FEB-2016
Construction
- UBQ10–nptIIo · TE9 · cassette de sélection, 309–3 097
- MCS · 6 sites uniques · en 3 107, 3 176
- SfiI ×2 · encadre le MCS · en 3 138, 5 414
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of B458pDoGusi-ocs* into B435p9oU10-LH*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| UBQ10 | Autre misc_feature | 309 | 1 784 | 1 476 | + |
| Ubi cds 5 | Promoteur misc_feature | 1 413 | 1 476 | 64 | + |
| int | Site misc_feature | 1 479 | 1 782 | 304 | + |
| nptIIo | Marqueur de sélection CDS | 1 804 | 2 102 | 299 | + |
| splice | Site misc_signal | 2 099 | 2 102 | 4 | + |
| int | Site CDS | 2 103 | 2 289 | 187 | + |
| splice | Site misc_signal | 2 288 | 2 291 | 4 | + |
| nptIIo | Marqueur de sélection CDS | 2 290 | 2 793 | 504 | + |
| TE9 | Terminateur misc_feature | 2 807 | 3 097 | 291 | + |
| ogus | Séquence codante CDS | 3 199 | 3 813 | 615 | + |
| int | Site misc_feature | 3 814 | 4 002 | 189 | + |
| ogus | Séquence codante CDS | 4 003 | 5 199 | 1 197 | + |
| Tocs | Terminateur misc_feature | 5 205 | 5 400 | 196 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 5 485 | 5 508 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 6 043 | 6 740 | 698 | + |
| bom | Origine / squelette misc_feature | 6 777 | 7 036 | 260 | + |
| pVS1 | Origine / squelette misc_feature | 7 289 | 10 994 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 11 178 | 12 188 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p9oU10-oGUS-int (B441; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9oU10-oGUS-int; RRID:SCR_029231)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.