pUC y expresión en E. coli · Múltiples casetes
pBA-UbiZ-UbiZ E962
Vector de clonación pUC.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2 | entre Amp'' y Ubi-int |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 18 | entre Amp'' y Ubi-int |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 25 | entre Amp'' y Ubi-int |
| SpeIA^CTAGT | 1539 | entre Ubi-int y OCS |
| BamHIG^GATCC | 1545 | entre Ubi-int y OCS |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1553 | entre Ubi-int y OCS |
| AscI (SgsI)GG^CGCGCC | 1560 | entre Ubi-int y OCS |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 1584 | en OCS |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 1774 | entre OCS y Ubi-int |
| HindIIIA^AGCTT | 1783 | entre OCS y Ubi-int |
| AvrII (XmaJI)C^CTAGG | 3305 | entre Ubi-int y NOS-T |
| MluIA^CGCGT | 3313 | entre Ubi-int y NOS-T |
| SalIG^TCGAC | 3321 | entre Ubi-int y NOS-T |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 3368 | en NOS-T |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 3603 | entre NOS-T y ColE1'' |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3610 | entre NOS-T y ColE1'' |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 3617 | entre NOS-T y ColE1'' |
| NotIGC^GGCCGC | 3621 | entre NOS-T y ColE1'' |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 3621 | entre NOS-T y ColE1'' |
| PacITTAAT^TAA | 3633 | entre NOS-T y ColE1'' |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 4482 | en Amp'' |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 5020 | en Amp'' |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 5228 | entre Amp'' y Ubi-int |
Corte doble: PstI (1535, 3298), XhoI (729, 2492), NcoI (1076, 2839), NheI (1149, 2912), BglII (976, 2739), ClaI (1262, 3025), ApaI (1089, 2852), SfiI (8, 3644), MfeI (263, 2026).
Sin sitio: EcoRI, SacI, SbfI, FseI, PmeI, AgeI, BstBI, HpaI, SacII, PvuII, BstEII, BbsI, SapI, AarI.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 1
- UbiZm
- Otros marcadores
- Amp''
- Tamaño
- 5262 bp, circular
- Fecha del registro
- 08-MAR-2023
Construcción
- Ubi-int–(vacío)–OCS · casete de expresión vacío, 31–1764
- Ubi-int–(vacío)–NOS-T · casete de expresión vacío, 1794–3592
- MCS · 6 sitios únicos · en 3603, 3633
- SfiI ×2 · flanquea 2 casetes · en 8, 3644
- AscI/PacI · un sitio de cada una · en 1560, 3633
Ligation of B656p6oA-UbiZ-UbiZ* into 594pUbi-BA*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| 'Ubi-int | Promotor misc_feature | 31 | 1538 | 1508 | + |
| Intron | Sitio misc_feature | 1017 | 1536 | 520 | + |
| OCS | Terminador misc_feature | 1569 | 1764 | 196 | + |
| 'Ubi-int | Promotor misc_feature | 1794 | 3301 | 1508 | + |
| Intron | Sitio misc_feature | 2780 | 3299 | 520 | + |
| NOS-T | Terminador misc_feature | 3339 | 3592 | 254 | + |
| ColE1'' | Origen / backbone misc_feature | 3681 | 4345 | 665 | − |
| LC | Sitio misc_feature | 4123 | 4123 | 1 | + |
| Amp'' | Marcador de selección CDS | 4346 | 5208 | 863 | − |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
pBA-UbiZ-UbiZ (E962; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pBA-UbiZ-UbiZ)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.