pUC et expression chez E. coli · Cassettes multiples
pBA-UbiZ-UbiZ E962
Vecteur de clonage pUC.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2 | entre Amp'' et Ubi-int |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 18 | entre Amp'' et Ubi-int |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 25 | entre Amp'' et Ubi-int |
| SpeIA^CTAGT | 1 539 | entre Ubi-int et OCS |
| BamHIG^GATCC | 1 545 | entre Ubi-int et OCS |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1 553 | entre Ubi-int et OCS |
| AscI (SgsI)GG^CGCGCC | 1 560 | entre Ubi-int et OCS |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 1 584 | dans OCS |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 1 774 | entre OCS et Ubi-int |
| HindIIIA^AGCTT | 1 783 | entre OCS et Ubi-int |
| AvrII (XmaJI)C^CTAGG | 3 305 | entre Ubi-int et NOS-T |
| MluIA^CGCGT | 3 313 | entre Ubi-int et NOS-T |
| SalIG^TCGAC | 3 321 | entre Ubi-int et NOS-T |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 3 368 | dans NOS-T |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 3 603 | entre NOS-T et ColE1'' |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3 610 | entre NOS-T et ColE1'' |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 3 617 | entre NOS-T et ColE1'' |
| NotIGC^GGCCGC | 3 621 | entre NOS-T et ColE1'' |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 3 621 | entre NOS-T et ColE1'' |
| PacITTAAT^TAA | 3 633 | entre NOS-T et ColE1'' |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 4 482 | dans Amp'' |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 5 020 | dans Amp'' |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 5 228 | entre Amp'' et Ubi-int |
Double coupure : PstI (1 535, 3 298), XhoI (729, 2 492), NcoI (1 076, 2 839), NheI (1 149, 2 912), BglII (976, 2 739), ClaI (1 262, 3 025), ApaI (1 089, 2 852), SfiI (8, 3 644), MfeI (263, 2 026).
Aucun site : EcoRI, SacI, SbfI, FseI, PmeI, AgeI, BstBI, HpaI, SacII, PvuII, BstEII, BbsI, SapI, AarI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- UbiZm
- Autres marqueurs
- Amp''
- Taille
- 5 262 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 08-MAR-2023
Construction
- Ubi-int–(vide)–OCS · cassette d’expression vide, 31–1 764
- Ubi-int–(vide)–NOS-T · cassette d’expression vide, 1 794–3 592
- MCS · 6 sites uniques · en 3 603, 3 633
- SfiI ×2 · encadre 2 cassettes · en 8, 3 644
- AscI/PacI · un site chacun · en 1 560, 3 633
Ligation of B656p6oA-UbiZ-UbiZ* into 594pUbi-BA*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| 'Ubi-int | Promoteur misc_feature | 31 | 1 538 | 1 508 | + |
| Intron | Site misc_feature | 1 017 | 1 536 | 520 | + |
| OCS | Terminateur misc_feature | 1 569 | 1 764 | 196 | + |
| 'Ubi-int | Promoteur misc_feature | 1 794 | 3 301 | 1 508 | + |
| Intron | Site misc_feature | 2 780 | 3 299 | 520 | + |
| NOS-T | Terminateur misc_feature | 3 339 | 3 592 | 254 | + |
| ColE1'' | Origine / squelette misc_feature | 3 681 | 4 345 | 665 | − |
| LC | Site misc_feature | 4 123 | 4 123 | 1 | + |
| Amp'' | Marqueur de sélection CDS | 4 346 | 5 208 | 863 | − |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
pBA-UbiZ-UbiZ (E962; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pBA-UbiZ-UbiZ)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.