pHSP-mGFPM-ocs E040
Vector de clonación pUC con HSP–GFP, para monocotiledóneas y dicotiledóneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 77 | entre ColE1 y HSP |
| XbaIT^CTAGA | 79 | entre ColE1 y HSP |
| NcoIC^CATGG | 87 | entre ColE1 y HSP |
| NotIGC^GGCCGC | 93 | entre ColE1 y HSP |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 93 | entre ColE1 y HSP |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 253 | en HSP |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 428 | en HSP |
| BbsI (BpiI)GAAGAC(2/6) | 504 | en HSP |
| SpeIA^CTAGT | 531 | entre HSP y GFP |
| BamHIG^GATCC | 538 | entre HSP y GFP |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 546 | entre HSP y GFP |
| PstICTGCA^G | 554 | entre HSP y GFP |
| EcoRIG^AATTC | 556 | entre HSP y GFP |
| HindIIIA^AGCTT | 562 | entre HSP y GFP |
| MluIA^CGCGT | 568 | entre HSP y GFP |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 1070 | en ST-LS1 |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 1156 | en GFP |
| SalIG^TCGAC | 1494 | entre GFP y OCS |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 1514 | en OCS |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 1702 | entre OCS y Amp |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 1704 | entre OCS y Amp |
| BglIIA^GATCT | 1714 | entre OCS y Amp |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 1725 | entre OCS y Amp |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 2697 | en Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 3231 | en Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 4302 | entre ColE1 y HSP |
Corte doble: KpnI (806, 1731), SfiI (92, 1708), BstBI (350, 925), PvuI (1883, 2928), PvuII (1852, 4365).
Sin sitio: SphI, XhoI, NdeI, NheI, EcoRV, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, HpaI, SacII, AatII, BstEII, AarI.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 1
- HSP
- Gen 1
- GFP
- Características
- dicotiledóneas y monocotiledóneas
- Otros marcadores
- Amp
- Tamaño
- 4510 bp, circular
- Fecha del registro
- 13-JUL-2020
Construcción
- MCS · 8 sitios únicos · en 504, 568
- SfiI ×2 · flanquea el MCS · en 92, 1708
Ligation of B594p2x35s-mGFPM-ocs* into A212pHSP-DGA*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| HSP | Otro misc_feature | 100 | 530 | 431 | + |
| GFP | Secuencia codificante CDS | 585 | 963 | 379 | + |
| ST-LS1 | Secuencia codificante CDS | 964 | 1152 | 189 | + |
| GFP | Secuencia codificante CDS | 1153 | 1490 | 338 | + |
| OCS | Terminador misc_feature | 1499 | 1694 | 196 | + |
| Amp | Marcador de selección misc_feature | 2510 | 3370 | 861 | + |
| ColE1 | Origen / backbone misc_feature | 3413 | 4129 | 717 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
pHSP-mGFPM-ocs (E040; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pHSP-mGFPM-ocs)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.