p6i-TE9
Vecteur binaire avec 35s–hptII, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 55 | entre LB et 35S |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 346 | dans 35S |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 479 | entre 35S et hpt |
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 1 475 | dans hpt |
| MluIA^CGCGT | 1 732 | entre hpt et E9 |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2 042 | entre E9 et RB |
| SpeIA^CTAGT | 2 081 | entre E9 et RB |
| BamHIG^GATCC | 2 087 | entre E9 et RB |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 2 103 | entre E9 et RB |
| HindIIIA^AGCTT | 2 111 | entre E9 et RB |
| SalIG^TCGAC | 2 123 | entre E9 et RB |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2 131 | entre E9 et RB |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2 133 | entre E9 et RB |
| BglIIA^GATCT | 2 143 | entre E9 et RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2 160 | entre E9 et RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 2 192 | entre E9 et RB |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 6 797 | dans pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 6 913 | dans pVS1 |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 8 278 | dans Sm/Sp |
Double coupure : EcoRI (749, 2 105), PstI (843, 2 042), SphI (2 048, 2 317), SmaI (490, 2 095), NcoI (858, 2 068), ClaI (2 118, 6 993), EcoRV (386, 2 704), ApaI (488, 2 154), SfiI (2 073, 2 137), FseI (4 464, 6 569), MfeI (1 030, 9 445), AgeI (7 407, 7 715), AatII (533, 2 583), BsaI (7 316, 7 736), SapI (3 636, 7 533).
Aucun site : SacI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, BsrGI, PvuII, AarI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- 35s
- Gène 1
- hptII
- Gène 2
- MCS
- Caractéristiques
- dicotylédones, hptII avec intron STLS1, clonage SfiI
- Autres marqueurs
- Sm/Sp
- Taille
- 9 679 bp, circulaire
Construction
- 35S–hpt · E9 · cassette de sélection, 61–2 032
- MCS · 11 sites uniques · en 2 042, 2 192
- SfiI ×2 · encadre le MCS · en 2 073, 2 137
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of HPT-Xho-Mlu* into 257p7-TE9*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| 35S | Promoteur misc_feature | 61 | 476 | 416 | + |
| hpt | Marqueur de sélection misc_feature | 506 | 923 | 418 | + |
| STLS1 | Autre misc_feature | 924 | 1 112 | 189 | + |
| hpt | Marqueur de sélection misc_feature | 1 113 | 1 720 | 608 | + |
| 'E9 | Terminateur misc_feature | 1 742 | 2 032 | 291 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 2 208 | 2 231 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 2 766 | 3 463 | 698 | + |
| pVS1 | Origine / squelette misc_feature | 4 012 | 7 717 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 7 901 | 8 911 | 1 011 | + |
| LB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 9 432 | 9 455 | 24 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p6i-TE9 (DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6i-TE9)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.