p9DN-35s-ocs G338
Vecteur binaire avec 35s–nptII, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| XbaIT^CTAGA | 163 | entre Left Border Region et P-NOS |
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 281 | dans P-NOS |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 363 | dans P-NOS |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 467 | entre P-NOS et NptIIo' |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 995 | dans 'NptIIo' |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 1 024 | dans 'NptIIo' |
| FseIGGCCGG^CC | 1 134 | dans 'NptIIo' |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 1 788 | entre E9 et 35S-Pro |
| NcoIC^CATGG | 1 814 | entre E9 et 35S-Pro |
| NotIGC^GGCCGC | 1 820 | entre E9 et 35S-Pro |
| SpeIA^CTAGT | 2 254 | dans 35S-Pro |
| BamHIG^GATCC | 2 261 | entre 35S-Pro et OCS |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 2 269 | entre 35S-Pro et OCS |
| EcoRIG^AATTC | 2 279 | entre 35S-Pro et OCS |
| HindIIIA^AGCTT | 2 285 | entre 35S-Pro et OCS |
| SalIG^TCGAC | 2 297 | entre 35S-Pro et OCS |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 2 317 | dans OCS |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2 505 | entre OCS et Right Border Region |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2 507 | entre OCS et Right Border Region |
| BglIIA^GATCT | 2 517 | entre OCS et Right Border Region |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2 534 | entre OCS et Right Border Region |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 2 566 | dans Right Border Region |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 2 957 | dans Right Border Region |
Double coupure : PstI (1 788, 2 277), SphI (1 794, 2 691), EcoRV (2 161, 3 078), ApaI (568, 2 528), MluI (1 478, 2 291), SfiI (1 819, 2 511), MfeI (14, 888), EagI (1 820, 2 948), XmnI (1 480, 2 121), BstEII (1 237, 6 369), AarI (958, 1 079).
Aucun site : NdeI, ClaI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, BstBI, HpaI, NsiI, BsrGI, PvuII, SapI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- 35s
- Gène 1
- nptII
- Caractéristiques
- dicotylédones
- Autres marqueurs
- NptIIo', 'NptIIo', strep/spec
- Taille
- 7 219 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 29-AUG-2024
Construction
- 35S-Pro–(vide)–OCS · cassette d’expression vide, 1 833–2 497
- MCS · 7 sites uniques · en 2 254, 2 317
- SfiI ×2 · encadre la cassette 35S-Pro–(empty)–OCS · en 1 819, 2 511
- Bordures de l’ADN-T · LB, RB
Ligation of B927-Xba-Kpn* into D010p6D35s*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| LB' | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P-NOS | Autre misc_feature | 169 | 466 | 298 | + |
| NptIIo' | Marqueur de sélection CDS | 485 | 783 | 299 | + |
| splice | Site misc_feature | 780 | 783 | 4 | + |
| 'intron | Séquence codante CDS | 784 | 970 | 187 | + |
| splice | Site misc_feature | 969 | 972 | 4 | + |
| ''NptIIo' | Marqueur de sélection CDS | 971 | 1 474 | 504 | + |
| 'E9 | Terminateur misc_feature | 1 488 | 1 778 | 291 | + |
| 35S-Pro | Promoteur misc_feature | 1 833 | 2 255 | 423 | + |
| TATA | Site CDS | 2 221 | 2 227 | 7 | + |
| OCS | Terminateur misc_feature | 2 302 | 2 497 | 196 | + |
| Right Border Region | Autre misc_feature | 2 537 | 3 139 | 603 | + |
| RB | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 2 582 | 2 605 | 24 | + |
| 'ColE1'' | Origine / squelette misc_feature | 3 153 | 3 811 | 659 | + |
| ''pVS1 ORI''' | Origine / squelette misc_feature | 3 840 | 5 803 | 1 964 | + |
| ParB | Séquence codante CDS | 4 166 | 5 341 | 1 176 | + |
| strep/spec | Marqueur de sélection CDS | 5 992 | 7 002 | 1 011 | + |
| Left Border Region | Bordure de l’ADN-T misc_feature | 7 070 | 163 | 0 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p9DN-35s-ocs (G338; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9DN-35s-ocs)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.