p9oN-U10 C889
Vecteur binaire avec Nos–nptII, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 421 | dans PNOS |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 607 | entre PNOS et NptIIo |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 1 928 | entre TE9 et Pro-Ubq10At |
| NcoIC^CATGG | 1 954 | entre TE9 et Pro-Ubq10At |
| SpeIA^CTAGT | 3 443 | entre Pro-Ubq10At et OCS |
| BamHIG^GATCC | 3 449 | entre Pro-Ubq10At et OCS |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 3 457 | entre Pro-Ubq10At et OCS |
| HindIIIA^AGCTT | 3 473 | entre Pro-Ubq10At et OCS |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 3 693 | entre OCS et BR |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 3 695 | entre OCS et BR |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3 722 | entre OCS et BR |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 3 754 | entre OCS et BR |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 4 145 | entre BR et ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 8 359 | dans pVS1 |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 8 555 | dans pVS1 |
Double coupure : EcoRI (2 627, 3 467), SalI (2 805, 3 485), PstI (1 928, 3 465), SphI (1 934, 3 879), SacI (1 135, 3 060), NdeI (5 260, 7 019), NheI (503, 8 475), BglII (3 372, 3 705), ApaI (708, 3 716), MluI (1 618, 3 479), SfiI (1 959, 3 699), MfeI (14, 1 028), AgeI (8 969, 9 277), XmnI (1 620, 2 228), BstEII (1 377, 9 840), AarI (1 098, 1 219).
Aucun site : AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, NsiI, BsrGI, PvuII.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 1
- Nos
- Gène 1
- nptII
- Promoteur 2
- Ubq10
- Caractéristiques
- dicotylédones
- Autres marqueurs
- NptIIo, Sm/Sp
- Taille
- 10 993 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 26-AUG-2020
Construction
- PNOS–NptIIo · TE9 · cassette de sélection, 309–1 918
- Pro-Ubq10At–(vide)–OCS · cassette d’expression vide, 1 967–3 685
- MCS · 4 sites uniques · en 3 443, 3 473
- SfiI ×2 · encadre la cassette Pro-Ubq10At–(empty)–OCS · en 1 959, 3 699
Ligation of 204pUbiAtmu-ocs* into B403p9oN-ocs-LH*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| BL | Site misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| PNOS | Promoteur misc_feature | 309 | 606 | 298 | + |
| NptIIo | Marqueur de sélection CDS | 625 | 923 | 299 | + |
| splice | Site misc_feature | 920 | 923 | 4 | + |
| int | Site CDS | 924 | 1 110 | 187 | + |
| splice | Site misc_feature | 1 109 | 1 112 | 4 | + |
| NptIIo | Marqueur de sélection CDS | 1 111 | 1 614 | 504 | + |
| TE9 | Terminateur misc_feature | 1 628 | 1 918 | 291 | + |
| Pro-Ubq10At | Promoteur misc_feature | 1 967 | 3 442 | 1 476 | + |
| TATA | Site misc_feature | 3 038 | 3 041 | 4 | + |
| Ubi cds 5 | Promoteur misc_feature | 3 071 | 3 134 | 64 | + |
| íntron | Autre misc_feature | 3 137 | 3 440 | 304 | + |
| OCS | Terminateur misc_feature | 3 490 | 3 685 | 196 | + |
| BR | Site misc_feature | 3 770 | 3 793 | 24 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 4 328 | 5 025 | 698 | + |
| pVS1 | Origine / squelette misc_feature | 5 574 | 9 279 | 3 706 | + |
| Sm/Sp | Marqueur de sélection CDS | 9 463 | 10 473 | 1 011 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
p9oN-U10 (C889; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9oN-U10)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.