p9oN-U10 C889
Vetor binário com Nos–nptII, para dicotiledôneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| SacII (Cfr42I)CCGC^GG | 421 | em PNOS |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 607 | entre PNOS e NptIIo |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 1.928 | entre TE9 e Pro-Ubq10At |
| NcoIC^CATGG | 1.954 | entre TE9 e Pro-Ubq10At |
| SpeIA^CTAGT | 3.443 | entre Pro-Ubq10At e OCS |
| BamHIG^GATCC | 3.449 | entre Pro-Ubq10At e OCS |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 3.457 | entre Pro-Ubq10At e OCS |
| HindIIIA^AGCTT | 3.473 | entre Pro-Ubq10At e OCS |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 3.693 | entre OCS e BR |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 3.695 | entre OCS e BR |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3.722 | entre OCS e BR |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 3.754 | entre OCS e BR |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 4.145 | entre BR e ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 8.359 | em pVS1 |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 8.555 | em pVS1 |
Corte duplo: EcoRI (2.627, 3.467), SalI (2.805, 3.485), PstI (1.928, 3.465), SphI (1.934, 3.879), SacI (1.135, 3.060), NdeI (5.260, 7.019), NheI (503, 8.475), BglII (3.372, 3.705), ApaI (708, 3.716), MluI (1.618, 3.479), SfiI (1.959, 3.699), MfeI (14, 1.028), AgeI (8.969, 9.277), XmnI (1.620, 2.228), BstEII (1.377, 9.840), AarI (1.098, 1.219).
Sem sítio: AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, NsiI, BsrGI, PvuII.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 1
- Nos
- Gene 1
- nptII
- Promotor 2
- Ubq10
- Características
- dicotiledôneas
- Outros marcadores
- NptIIo, Sm/Sp
- Tamanho
- 10.993 bp, circular
- Data do registro
- 26-AUG-2020
Construção
- PNOS–NptIIo · TE9 · cassete de seleção, 309–1.918
- Pro-Ubq10At–(vazio)–OCS · cassete de expressão vazio, 1.967–3.685
- MCS · 4 sítios únicos · em 3.443, 3.473
- SfiI ×2 · flanqueia o cassete Pro-Ubq10At–(empty)–OCS · em 1.959, 3.699
Ligation of 204pUbiAtmu-ocs* into B403p9oN-ocs-LH*
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| BL | Sítio misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| PNOS | Promotor misc_feature | 309 | 606 | 298 | + |
| NptIIo | Marcador de seleção CDS | 625 | 923 | 299 | + |
| splice | Sítio misc_feature | 920 | 923 | 4 | + |
| int | Sítio CDS | 924 | 1.110 | 187 | + |
| splice | Sítio misc_feature | 1.109 | 1.112 | 4 | + |
| NptIIo | Marcador de seleção CDS | 1.111 | 1.614 | 504 | + |
| TE9 | Terminador misc_feature | 1.628 | 1.918 | 291 | + |
| Pro-Ubq10At | Promotor misc_feature | 1.967 | 3.442 | 1.476 | + |
| TATA | Sítio misc_feature | 3.038 | 3.041 | 4 | + |
| Ubi cds 5 | Promotor misc_feature | 3.071 | 3.134 | 64 | + |
| íntron | Outro misc_feature | 3.137 | 3.440 | 304 | + |
| OCS | Terminador misc_feature | 3.490 | 3.685 | 196 | + |
| BR | Sítio misc_feature | 3.770 | 3.793 | 24 | + |
| ColE1 | Origem / backbone misc_feature | 4.328 | 5.025 | 698 | + |
| pVS1 | Origem / backbone misc_feature | 5.574 | 9.279 | 3.706 | + |
| Sm/Sp | Marcador de seleção CDS | 9.463 | 10.473 | 1.011 | + |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
p9oN-U10 (C889; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9oN-U10)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.