pUC et expression chez E. coli
pUbiM-dmoLgus 955
Vecteur de clonage pUC avec UbiZm–oGus, pour les monocotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| PacITTAAT^TAA | 58 | entre ColE1 et UbiZm |
| NotIGC^GGCCGC | 64 | entre ColE1 et UbiZm |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 64 | entre ColE1 et UbiZm |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 310 | dans UbiZm |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 776 | dans UbiZm |
| NcoIC^CATGG | 1 123 | dans Intron |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 1 136 | dans Intron |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 1 196 | dans Intron |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 1 309 | dans Intron |
| SpeIA^CTAGT | 1 586 | entre UbiZm et ogus |
| BamHIG^GATCC | 1 593 | entre UbiZm et ogus |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1 601 | entre UbiZm et ogus |
| HindIIIA^AGCTT | 1 623 | entre UbiZm et ogus |
| MluIA^CGCGT | 1 629 | entre UbiZm et ogus |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 1 642 | entre UbiZm et ogus |
| AarICACCTGC(4/8) | 2 254 | dans ogus |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 2 362 | dans ogus |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 2 440 | dans ogus |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 3 522 | entre ogus et NOS |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 3 560 | dans NOS |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3 788 | entre NOS et Amp |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 3 793 | entre NOS et Amp |
Double coupure : XbaI (109, 1 104), SalI (1 635, 3 525), BglII (1 023, 2 465), SfiI (48, 3 806), StuI (2 968, 3 809), NsiI (1 354, 3 651), XmnI (3 099, 4 053), BsaI (2 696, 4 587).
Aucun site : EcoRI, SphI, AscI, SbfI, FseI, PmeI, AvrII, BsiWI, AgeI, BstBI, BsrGI, SacII, PvuII, BstEII, BbsI, BsmBI, SapI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 2
- UbiZm
- Gène 2
- oGus
- Caractéristiques
- GUS optimisé pour la transformation des monocotylédones
- Autres marqueurs
- Amp
- Taille
- 5 383 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 20-JUN-2013
Construction
- UbiZm–ogus–Amp · cassette avec insert, 77–4 728
- MCS · 6 sites uniques · en 1 586, 1 642
- SfiI ×2 · encadre le MCS · en 48, 3 806
Ligation of 955pUbiM-dmoLgusxx* into 955pUbiM-dmoLgusx*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| UbiZm | Promoteur misc_feature | 77 | 1 583 | 1 507 | + |
| Intron | Site misc_feature | 1 064 | 1 583 | 520 | + |
| ogus | Séquence codante CDS | 1 652 | 3 463 | 1 812 | + |
| NOS | Autre misc_feature | 3 531 | 3 784 | 254 | + |
| Amp | Marqueur de sélection CDS | 3 866 | 4 728 | 863 | + |
| ColE1 | Site misc_feature | 4 729 | 10 | 0 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
pUbiM-dmoLgus (955; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pUbiM-dmoLgus)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.