pUbiM-dmoLgus 955
Vetor de clonagem pUC com UbiZm–oGus, para monocotiledôneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| PacITTAAT^TAA | 58 | entre ColE1 e UbiZm |
| NotIGC^GGCCGC | 64 | entre ColE1 e UbiZm |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 64 | entre ColE1 e UbiZm |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 310 | em UbiZm |
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 776 | em UbiZm |
| NcoIC^CATGG | 1.123 | em Intron |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 1.136 | em Intron |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 1.196 | em Intron |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 1.309 | em Intron |
| SpeIA^CTAGT | 1.586 | entre UbiZm e ogus |
| BamHIG^GATCC | 1.593 | entre UbiZm e ogus |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1.601 | entre UbiZm e ogus |
| HindIIIA^AGCTT | 1.623 | entre UbiZm e ogus |
| MluIA^CGCGT | 1.629 | entre UbiZm e ogus |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 1.642 | entre UbiZm e ogus |
| AarICACCTGC(4/8) | 2.254 | em ogus |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 2.362 | em ogus |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 2.440 | em ogus |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 3.522 | entre ogus e NOS |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 3.560 | em NOS |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 3.788 | entre NOS e Amp |
| SwaI (SmiI)ATTT^AAAT | 3.793 | entre NOS e Amp |
Corte duplo: XbaI (109, 1.104), SalI (1.635, 3.525), BglII (1.023, 2.465), SfiI (48, 3.806), StuI (2.968, 3.809), NsiI (1.354, 3.651), XmnI (3.099, 4.053), BsaI (2.696, 4.587).
Sem sítio: EcoRI, SphI, AscI, SbfI, FseI, PmeI, AvrII, BsiWI, AgeI, BstBI, BsrGI, SacII, PvuII, BstEII, BbsI, BsmBI, SapI.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 2
- UbiZm
- Gene 2
- oGus
- Características
- GUS otimizado para transformação de monocotiledôneas
- Outros marcadores
- Amp
- Tamanho
- 5.383 bp, circular
- Data do registro
- 20-JUN-2013
Construção
- UbiZm–ogus–Amp · cassete com inserto, 77–4.728
- MCS · 6 sítios únicos · em 1.586, 1.642
- SfiI ×2 · flanqueia o MCS · em 48, 3.806
Ligation of 955pUbiM-dmoLgusxx* into 955pUbiM-dmoLgusx*
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| UbiZm | Promotor misc_feature | 77 | 1.583 | 1.507 | + |
| Intron | Sítio misc_feature | 1.064 | 1.583 | 520 | + |
| ogus | Sequência codificadora CDS | 1.652 | 3.463 | 1.812 | + |
| NOS | Outro misc_feature | 3.531 | 3.784 | 254 | + |
| Amp | Marcador de seleção CDS | 3.866 | 4.728 | 863 | + |
| ColE1 | Sítio misc_feature | 4.729 | 10 | 0 | + |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
pUbiM-dmoLgus (955; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pUbiM-dmoLgus)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.