p6o2x35s-UbiZm-LGFP C192
Vetor binário com 2x35s–hptII e UbiZm–link-EGFP, para monocotiledôneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2.648 | entre E9 e Ubi |
| NsiI (Mph1103I)ATGCA^T | 3.970 | em Intron |
| SpeIA^CTAGT | 4.202 | entre Ubi e link |
| BamHIG^GATCC | 4.209 | entre Ubi e link |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 4.217 | entre Ubi e link |
| EcoRIG^AATTC | 4.227 | entre Ubi e link |
| HindIIIA^AGCTT | 4.233 | entre Ubi e link |
| MluIA^CGCGT | 4.239 | entre Ubi e link |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 4.245 | entre Ubi e link |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 4.642 | em GFPm |
| SalIG^TCGAC | 5.212 | entre GFPm e OCS |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 5.422 | entre OCS e RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 5.449 | entre OCS e RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 5.481 | entre OCS e RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 5.872 | entre RB e ColE1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 10.086 | em pVS1 |
Corte duplo: SphI (2.654, 5.606), XhoI (1.098, 3.392), NcoI (2.674, 3.739), NheI (3.812, 10.202), BglII (3.639, 5.432), EcoRV (966, 5.993), ApaI (3.752, 5.443), SfiI (2.679, 5.426), FseI (7.753, 9.858), AgeI (10.696, 11.004), StuI (2.012, 5.420), SacII (1.486, 2.316), BstEII (1.406, 11.567), SapI (6.925, 10.822).
Sem sítio: SacI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, HpaI, PvuII, AarI.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 1
- 2x35s
- Gene 1
- hptII
- Promotor 2
- UbiZm
- Gene 2
- link-EGFP
- Características
- monocotiledôneas
- Outros marcadores
- Sm/Sp
- Tamanho
- 12.720 bp, circular
- Data do registro
- 29-SEP-2017
Construção
- P2x35s–hptII · E9 · cassete de seleção, 314–2.638
- Ubi–GFPm · OCS · cassete com inserto, 2.693–5.412
- MCS · 7 sítios únicos · em 4.202, 4.245
- SfiI ×2 · flanqueia o cassete Ubi–GFPm · em 2.679, 5.426
- Bordas do T-DNA · LB, RB
Ligation of B633pUbiZm-LGFP* into B483p6o2x35s-LH*
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Borda do T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P2x35s | Promotor misc_feature | 314 | 1.098 | 785 | + |
| hptII | Marcador de seleção CDS | 1.116 | 1.685 | 570 | + |
| int | Sítio misc_feature | 1.686 | 1.874 | 189 | + |
| hptII | Marcador de seleção CDS | 1.875 | 2.330 | 456 | + |
| E9 | Terminador misc_feature | 2.348 | 2.638 | 291 | + |
| Ubi | Promotor misc_feature | 2.693 | 4.201 | 1.509 | + |
| Intron | Sítio misc_feature | 3.680 | 4.199 | 520 | + |
| link | Sítio misc_feature | 4.251 | 4.301 | 51 | + |
| GFPm | Sequência codificadora CDS | 4.302 | 4.680 | 379 | + |
| Int | Sítio CDS | 4.681 | 4.869 | 189 | + |
| GFPm | Sequência codificadora CDS | 4.870 | 5.207 | 338 | + |
| OCS | Terminador misc_feature | 5.217 | 5.412 | 196 | + |
| RB | Borda do T-DNA misc_feature | 5.497 | 5.520 | 24 | + |
| ColE1 | Origem / backbone misc_feature | 6.055 | 6.752 | 698 | + |
| pVS1 | Origem / backbone misc_feature | 7.301 | 11.006 | 3.706 | + |
| Sm/Sp | Marcador de seleção CDS | 11.190 | 12.200 | 1.011 | + |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
p6o2x35s-UbiZm-LGFP (C192; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p6o2x35s-UbiZm-LGFP)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.