p7oUH-LH-ocs B420
Vetor binário com UbiHa–bar, para dicotiledôneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| XhoI (PaeR7I)C^TCGAG | 653 | entre UbiZm e bar |
| AarICACCTGC(4/8) | 1.194 | em bar |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 1.414 | entre bar e TE9 |
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 1.722 | entre TE9 e Tocs |
| NcoIC^CATGG | 1.748 | entre TE9 e Tocs |
| SpeIA^CTAGT | 1.761 | entre TE9 e Tocs |
| BamHIG^GATCC | 1.767 | entre TE9 e Tocs |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 1.775 | entre TE9 e Tocs |
| EcoRIG^AATTC | 1.785 | entre TE9 e Tocs |
| HindIIIA^AGCTT | 1.791 | entre TE9 e Tocs |
| SalIG^TCGAC | 1.803 | entre TE9 e Tocs |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2.011 | entre Tocs e RB |
| BglIIA^GATCT | 2.023 | entre Tocs e RB |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2.040 | entre Tocs e RB |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 2.072 | entre Tocs e RB |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 2.463 | entre RB e ColE1 |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 2.584 | entre RB e ColE1 |
| BbsI (BpiI)GAAGAC(2/6) | 3.873 | entre bom e pVS1 |
| BsiWI (Pfl23II)C^GTACG | 6.677 | em pVS1 |
| NheI (BmtI)G^CTAGC | 6.793 | em pVS1 |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 6.873 | em pVS1 |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 8.158 | em Sm/Sp |
Corte duplo: XbaI (303, 384), PstI (1.722, 1.783), SphI (1.728, 2.197), NdeI (3.578, 5.337), MluI (1.412, 1.797), SfiI (1.753, 2.017), FseI (4.344, 6.449), MfeI (14, 1.011), AgeI (7.287, 7.595), AflII (320, 2.013), SacII (1.294, 1.311), SapI (3.516, 7.413).
Sem sítio: SacI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, BstBI, HpaI, NsiI, BsrGI, PvuII.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 1
- UbiHa
- Gene 1
- bar
- Gene 2
- MCS
- Características
- dicotiledôneas
- Outros marcadores
- Sm/Sp
- Tamanho
- 9.311 bp, circular
- Data do registro
- 22-JAN-2016
Construção
- UbiZm–bar · TE9 · cassete de seleção, 316–1.712
- MCS · 8 sítios únicos · em 1.722, 1.803
- SfiI ×2 · flanqueia o MCS · em 1.753, 2.017
- Bordas do T-DNA · LB, RB
Ligation of pOCS-BM* into B417p7oUH-LH*
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| LB | Borda do T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| UbiZm | Promotor misc_feature | 316 | 651 | 336 | + |
| cat | Sítio misc_signal | 433 | 435 | 3 | + |
| cat | Sítio misc_signal | 436 | 438 | 3 | + |
| cat | Sítio misc_signal | 469 | 471 | 3 | + |
| cat | Sítio misc_signal | 498 | 500 | 3 | + |
| cat | Sítio misc_signal | 509 | 511 | 3 | + |
| cat | Sítio misc_signal | 530 | 532 | 3 | + |
| cat | Sítio misc_signal | 533 | 535 | 3 | + |
| tata | Sítio misc_signal | 538 | 541 | 4 | + |
| mRNA | Sequência codificadora CDS | 569 | 651 | 83 | + |
| bar | Marcador de seleção CDS | 671 | 904 | 234 | + |
| int | Sítio misc_feature | 905 | 1.093 | 189 | + |
| bar | Marcador de seleção CDS | 1.094 | 1.409 | 316 | + |
| TE9 | Terminador misc_feature | 1.422 | 1.712 | 291 | + |
| Tocs | Terminador misc_feature | 1.808 | 2.003 | 196 | + |
| RB | Borda do T-DNA misc_feature | 2.088 | 2.111 | 24 | + |
| ColE1 | Origem / backbone misc_feature | 2.646 | 3.343 | 698 | + |
| bom | Origem / backbone misc_feature | 3.380 | 3.639 | 260 | + |
| pVS1 | Origem / backbone misc_feature | 3.892 | 7.597 | 3.706 | + |
| Sm/Sp | Marcador de seleção CDS | 7.781 | 8.791 | 1.011 | + |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
p7oUH-LH-ocs (B420; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p7oUH-LH-ocs)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.