p9M2x35s-ZmUbi-Cpf1TS G799
Vetor CRISPR/Cas com 2x35s–nptII e UbiZm–LbCPf1, para monocotiledôneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Abre no SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE e Geneious.
Sítios de restrição
| Corte único · sítio | Corta em | Localização |
|---|---|---|
| SbfI (SdaI)CCTGCA^GG | 2.286 | entre 'E9 e Ubi-int'' |
| NotIGC^GGCCGC | 2.295 | entre 'E9 e Ubi-int'' |
| NcoIC^CATGG | 3.348 | em Intron' |
| BamHIG^GATCC | 3.810 | entre Ubi-int'' e Kozak |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 7.610 | entre ORF-1 e NOS-T |
| EcoRIG^AATTC | 7.870 | entre NOS-T e PU6C4 |
| HindIIIA^AGCTT | 8.361 | entre DR e stop |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 8.426 | entre LacZ' e Right Border Region |
| PmeI (MssI)GTTT^AAAC | 8.458 | em Right Border Region |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 8.583 | em Right Border Region |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 8.849 | em Right Border Region |
Corte duplo: SacI (1.486, 6.103), XhoI (958, 3.001), NheI (3.421, 8.384), BglII (3.248, 8.404), SfiI (2.294, 8.398), StuI (2.288, 8.392), NsiI (3.579, 7.733), EagI (2.295, 8.840), BsaI (8.345, 8.377).
Sem sítio: SalI, SpeI, MluI, AscI, PacI, FseI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, HpaI, BsrGI, SacII, PvuII, BsmBI.
Calculado a partir da sequência GenBank para 50 enzimas comuns; as posições são o corte na fita superior, sem metilação Dam/Dcm. Compare vetores no localizador de sítios de restrição.
- Promotor 1
- 2x35s
- Gene 1
- nptII
- Promotor 2
- UbiZm
- Gene 2
- LbCPf1
- Características
- monocotiledôneas
- Outros marcadores
- NptIIo, NptIIo', strep/spec
- Tamanho
- 13.111 bp, circular
- Data do registro
- 24-JUN-2025
Construção
- P2x35s–NptIIo · E9 · cassete de seleção, 174–2.276
- PU6C4 (sem scaffold anotado) · cassete de gRNA, 7.876–8.328
- SfiI ×2 · flanqueia o cassete PU6C4 (no scaffold annotated) · em 2.294, 8.398
- Bordas do T-DNA · LB, RB
Ligation of G798pD35s-ZmUbi-Cpf1TS* into F652p9M2x35s_cut*
Extraído do arquivo GenBank; compare todos os vetores na tabela de múltiplos cassetes de expressão.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Início | Fim | Comprimento | Fita |
|---|---|---|---|---|---|
| LB' | Borda do T-DNA misc_feature | 1 | 24 | 24 | + |
| P2x35s' | Promotor misc_feature | 174 | 958 | 785 | + |
| NptIIo | Marcador de seleção CDS | 976 | 1.274 | 299 | + |
| intron | Sítio CDS | 1.275 | 1.461 | 187 | + |
| NptIIo' | Marcador de seleção CDS | 1.462 | 1.965 | 504 | + |
| Change to T | Sítio misc_feature | 1.623 | 1.623 | 1 | + |
| ''E9 | Terminador misc_feature | 1.987 | 2.276 | 290 | + |
| Ubi-int'' | Sequência codificadora CDS | 2.302 | 3.809 | 1.508 | + |
| Intron' | Sítio misc_feature | 3.289 | 3.808 | 520 | + |
| Kozak | Sítio misc_feature | 3.820 | 3.824 | 5 | + |
| ORF-1 | Sequência codificadora CDS | 3.825 | 7.607 | 3.783 | + |
| NLS | Sítio misc_feature | 3.831 | 3.851 | 21 | + |
| D172R | Sítio misc_feature | 4.338 | 4.340 | 3 | + |
| NLS | Sequência codificadora CDS | 7.557 | 7.604 | 48 | + |
| NOS-T | Terminador misc_feature | 7.613 | 7.866 | 254 | + |
| PU6C4 | Promotor misc_feature | 7.876 | 8.328 | 453 | + |
| DR | Sítio CDS | 8.329 | 8.350 | 22 | + |
| stop | Sítio CDS | 8.377 | 8.383 | 7 | + |
| LacZ' | Sítio CDS | 8.396 | 8.398 | 3 | − |
| Right Border Region | Outro misc_feature | 8.429 | 9.031 | 603 | + |
| RB | Borda do T-DNA misc_feature | 8.474 | 8.497 | 24 | + |
| 'ColE1'' | Origem / backbone misc_feature | 9.045 | 9.703 | 659 | + |
| ''pVS1 ORI''' | Origem / backbone misc_feature | 9.732 | 11.695 | 1.964 | + |
| ParB | Sequência codificadora CDS | 10.058 | 11.233 | 1.176 | + |
| strep/spec | Marcador de seleção CDS | 11.884 | 12.894 | 1.011 | + |
| Left Border Region | Borda do T-DNA misc_feature | 12.962 | 163 | 0 | + |
PromotorSequência codificadoraTerminadorMarcador de seleçãoOrigem / backboneBorda do T-DNASítio
Os tipos de elemento são deduzidos das anotações do arquivo GenBank; o próprio arquivo é a referência.
Como citar
Cite o vetor assim na seção de Métodos (Material e Métodos).
p9M2x35s-ZmUbi-Cpf1TS (G799; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/crispr/p9M2x35s-ZmUbi-Cpf1TS)Seu artigo usa um dos nossos vetores? Conte para nós.