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DNA Cloning Service
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Binäre Vektoren

p9o-UbiAt-GusiX C786

Binärer Vektor mit 35s–nptII und Ubq10–gusX, für Dikotyle.

24681012pVS1Pro-Ubq10AtGusXSm/SpColE1GusXNptIIoP35SíntronNptIIoTE9bomOCS''IntronintUbi cds 5LBRBXhoI (727)PstI, SbfI, NcoIEcoRI (2747)SpeI, BamHIHpaI, BstBIHindIII (5583)StuI, AflII, KpnI, PmeIBsiWI, NheI, ClaIC786p9o-UbiAt-Gu13.103 bp

GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq

Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.

Restriktionsschnittstellen

Single Cutter · SchnittstelleSchneidet beiLage
XhoI (PaeR7I)C^TCGAG727zwischen P35S und NptIIo
PstICTGCA^G2.048zwischen TE9 und Pro-Ubq10At
SbfI (SdaI)CCTGCA^GG2.048zwischen TE9 und Pro-Ubq10At
NcoIC^CATGG2.074zwischen TE9 und Pro-Ubq10At
EcoRIG^AATTC2.747in Pro-Ubq10At
SpeIA^CTAGT3.563zwischen Pro-Ubq10At und GusX
BamHIG^GATCC3.569zwischen Pro-Ubq10At und GusX
HpaI (KspAI)GTT^AAC3.880in GusX
BstBI (Bsp119I)TT^CGAA3.924in GusX
HindIIIA^AGCTT5.583zwischen GusX und OCS
StuI (Eco147I)AGG^CCT5.803zwischen OCS und RB
AflII (BspTI)C^TTAAG5.805zwischen OCS und RB
KpnI (Acc65I)GGTAC^C5.832zwischen OCS und RB
PmeI (MssI)GTTT^AAAC5.864zwischen OCS und RB
BsiWI (Pfl23II)C^GTACG10.469in pVS1
NheI (BmtI)G^CTAGC10.585in pVS1
ClaI (BspDI)AT^CGAT10.665in pVS1

Schneiden zweimal: SalI (2.925, 5.595), SphI (2.054, 5.989), SacI (1.255, 3.180), NdeI (7.370, 9.129), BglII (3.492, 5.815), ApaI (828, 5.826), MluI (1.738, 5.589), SfiI (2.079, 5.809), AgeI (11.079, 11.387).

Keine Schnittstelle: SmaI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, NsiI, BsrGI, SacII, PvuII.

Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.

Promotor 1
35s
Gen 1
nptII
Promotor 2
Ubq10
Gen 2
gusX
Merkmale
Dikotyle
Weitere Marker
NptIIo, Sm/Sp
Größe
13.103 bp, zirkulär
Datum des Eintrags
26-AUG-2020

Konstrukt

  • P35S–NptIIo · TE9 · Selektionskassette, 309–2.038
  • Pro-Ubq10At–GusX · OCS · Kassette mit Insert, 2.087–5.795
  • MCS · 4 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 5.803, 5.864
  • SfiI ×2 · flankiert die Kassette Pro-Ubq10At–GusX · Pos. 2.079, 5.809
  • T-DNA-Grenzen (Borders) · LB, RB

Ligation of GusiX-Bam-Hind* into C599p9o-LH-U10-ocs*

Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.

300 €

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Annotierte Elemente

ElementTypStartEndeLängeStrang
LBT-DNA-Grenze (Border) misc_feature12424+
P35SPromotor misc_feature309724416+
NptIIoSelektionsmarker CDS7451.043299+
spliceSchnittstelle misc_feature1.0401.0434+
intSchnittstelle CDS1.0441.230187+
spliceSchnittstelle misc_feature1.2291.2324+
NptIIoSelektionsmarker CDS1.2311.734504+
TE9Terminator misc_feature1.7482.038291+
Pro-Ubq10AtPromotor misc_feature2.0873.5621.476+
TATASchnittstelle misc_feature3.1583.1614+
Ubi cds 5Promotor misc_feature3.1913.25464+
íntronSonstiges misc_feature3.2573.560304+
GusXKodierende Sequenz CDS3.5844.198615+
''IntronSchnittstelle misc_feature4.1994.387189+
GusXKodierende Sequenz CDS4.3885.5831.196+
OCSTerminator misc_feature5.6005.795196+
RBT-DNA-Grenze (Border) misc_feature5.8805.90324+
ColE1Origin / Backbone misc_feature6.4387.135698+
bomOrigin / Backbone misc_feature7.1727.431260+
pVS1Origin / Backbone misc_feature7.68411.3893.706+
Sm/SpSelektionsmarker CDS11.57312.5831.011+

PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle

Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.

Zitierweise

Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.

p9o-UbiAt-GusiX (C786; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9o-UbiAt-GusiX)

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