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DNA Cloning Service
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Binaires

p9o-UbiAt-GusiX C786

Vecteur binaire avec 35s–nptII et Ubq10–gusX, pour les dicotylédones.

24681012pVS1Pro-Ubq10AtGusXSm/SpColE1GusXNptIIoP35SíntronNptIIoTE9bomOCS''IntronintUbi cds 5LBRBXhoI (727)PstI, SbfI, NcoIEcoRI (2747)SpeI, BamHIHpaI, BstBIHindIII (5583)StuI, AflII, KpnI, PmeIBsiWI, NheI, ClaIC786p9o-UbiAt-Gu13 103 bp

GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq

S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.

Sites de restriction

Enzyme à coupure unique · siteCoupe enEmplacement
XhoI (PaeR7I)C^TCGAG727entre P35S et NptIIo
PstICTGCA^G2 048entre TE9 et Pro-Ubq10At
SbfI (SdaI)CCTGCA^GG2 048entre TE9 et Pro-Ubq10At
NcoIC^CATGG2 074entre TE9 et Pro-Ubq10At
EcoRIG^AATTC2 747dans Pro-Ubq10At
SpeIA^CTAGT3 563entre Pro-Ubq10At et GusX
BamHIG^GATCC3 569entre Pro-Ubq10At et GusX
HpaI (KspAI)GTT^AAC3 880dans GusX
BstBI (Bsp119I)TT^CGAA3 924dans GusX
HindIIIA^AGCTT5 583entre GusX et OCS
StuI (Eco147I)AGG^CCT5 803entre OCS et RB
AflII (BspTI)C^TTAAG5 805entre OCS et RB
KpnI (Acc65I)GGTAC^C5 832entre OCS et RB
PmeI (MssI)GTTT^AAAC5 864entre OCS et RB
BsiWI (Pfl23II)C^GTACG10 469dans pVS1
NheI (BmtI)G^CTAGC10 585dans pVS1
ClaI (BspDI)AT^CGAT10 665dans pVS1

Double coupure : SalI (2 925, 5 595), SphI (2 054, 5 989), SacI (1 255, 3 180), NdeI (7 370, 9 129), BglII (3 492, 5 815), ApaI (828, 5 826), MluI (1 738, 5 589), SfiI (2 079, 5 809), AgeI (11 079, 11 387).

Aucun site : SmaI, AscI, PacI, SwaI, AvrII, NsiI, BsrGI, SacII, PvuII.

Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.

Promoteur 1
35s
Gène 1
nptII
Promoteur 2
Ubq10
Gène 2
gusX
Caractéristiques
dicotylédones
Autres marqueurs
NptIIo, Sm/Sp
Taille
13 103 bp, circulaire
Date de l’enregistrement
26-AUG-2020

Construction

  • P35S–NptIIo · TE9 · cassette de sélection, 309–2 038
  • Pro-Ubq10At–GusX · OCS · cassette avec insert, 2 087–5 795
  • MCS · 4 sites uniques · en 5 803, 5 864
  • SfiI ×2 · encadre la cassette Pro-Ubq10At–GusX · en 2 079, 5 809
  • Bordures de l’ADN-T · LB, RB

Ligation of GusiX-Bam-Hind* into C599p9o-LH-U10-ocs*

Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.

300 €

CommanderDemander une variante

Éléments annotés

ÉlémentTypeDébutFinLongueurBrin
LBBordure de l’ADN-T misc_feature12424+
P35SPromoteur misc_feature309724416+
NptIIoMarqueur de sélection CDS7451 043299+
spliceSite misc_feature1 0401 0434+
intSite CDS1 0441 230187+
spliceSite misc_feature1 2291 2324+
NptIIoMarqueur de sélection CDS1 2311 734504+
TE9Terminateur misc_feature1 7482 038291+
Pro-Ubq10AtPromoteur misc_feature2 0873 5621 476+
TATASite misc_feature3 1583 1614+
Ubi cds 5Promoteur misc_feature3 1913 25464+
íntronAutre misc_feature3 2573 560304+
GusXSéquence codante CDS3 5844 198615+
''IntronSite misc_feature4 1994 387189+
GusXSéquence codante CDS4 3885 5831 196+
OCSTerminateur misc_feature5 6005 795196+
RBBordure de l’ADN-T misc_feature5 8805 90324+
ColE1Origine / squelette misc_feature6 4387 135698+
bomOrigine / squelette misc_feature7 1727 431260+
pVS1Origine / squelette misc_feature7 68411 3893 706+
Sm/SpMarqueur de sélection CDS11 57312 5831 011+

PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite

Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.

Comment citer

Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.

p9o-UbiAt-GusiX (C786; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/binaries/p9o-UbiAt-GusiX)

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