p35s-LmEGFP D360
pUC-Klonierungsvektor mit 35s–mEGFP, für Monokotyle und Dikotyle.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Lässt sich öffnen in SnapGene Viewer (kostenlos), Benchling, ApE und Geneious.
Restriktionsschnittstellen
| Single Cutter · Schnittstelle | Schneidet bei | Lage |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 77 | zwischen ColE1 und 35S-Pro |
| XbaIT^CTAGA | 79 | zwischen ColE1 und 35S-Pro |
| NcoIC^CATGG | 87 | zwischen ColE1 und 35S-Pro |
| NotIGC^GGCCGC | 93 | zwischen ColE1 und 35S-Pro |
| EagI (Eco52I)C^GGCCG | 93 | zwischen ColE1 und 35S-Pro |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 434 | in 35S-Pro |
| SpeIA^CTAGT | 527 | in 35S-Pro |
| BamHIG^GATCC | 534 | zwischen 35S-Pro und mEGFP |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 542 | zwischen 35S-Pro und mEGFP |
| PstICTGCA^G | 550 | zwischen 35S-Pro und mEGFP |
| EcoRIG^AATTC | 552 | zwischen 35S-Pro und mEGFP |
| HindIIIA^AGCTT | 558 | zwischen 35S-Pro und mEGFP |
| MluIA^CGCGT | 564 | zwischen 35S-Pro und mEGFP |
| BsrGI (Bsp1407I)T^GTACA | 570 | zwischen 35S-Pro und mEGFP |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 967 | in mEGFP |
| MfeI (MunI)C^AATTG | 1.112 | in ST-LS1 |
| ClaI (BspDI)AT^CGAT | 1.198 | in mEGFP |
| SalIG^TCGAC | 1.537 | zwischen mEGFP und OCS |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 1.557 | in OCS |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 1.745 | zwischen OCS und Amp |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 1.747 | zwischen OCS und Amp |
| BglIIA^GATCT | 1.757 | zwischen OCS und Amp |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 1.768 | zwischen OCS und Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 1.774 | zwischen OCS und Amp |
| BsaI (Eco31I)GGTCTC(1/5) | 3.274 | in Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 4.345 | zwischen ColE1 und 35S-Pro |
Schneiden zweimal: SfiI (92, 1.751), PvuI (1.926, 2.971), PvuII (1.895, 4.408), XmnI (394, 2.740).
Keine Schnittstelle: SphI, XhoI, NdeI, NheI, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, AgeI, HpaI, NsiI, SacII, AatII, BstEII, AarI.
Aus der GenBank-Sequenz berechnet für 50 gängige Enzyme; Positionen bezeichnen den Schnitt im oberen Strang, ohne Dam/Dcm-Methylierung. Vektoren vergleichen in der Restriktionsschnittstellen-Suche.
- Promotor 1
- 35s
- Gen 1
- mEGFP
- Merkmale
- Dikotyle und Monokotyle
- Weitere Marker
- Amp
- Größe
- 4.553 bp, zirkulär
- Datum des Eintrags
- 26-AUG-2020
Konstrukt
- 35S-Pro–mEGFP · OCS · Kassette mit Insert, 106–1.737
- MCS · 8 Single-Cutter-Schnittstellen · Pos. 527, 570
- SfiI ×2 · flankiert die Kassette 35S-Pro–mEGFP · Pos. 92, 1.751
Ligation of GFP-Hind-Sal* into B629p35s-LGFP*
Ausgelesen aus der GenBank-Datei; alle Vektoren im Vergleich in der Tabelle Mehrere Expressionskassetten.
Annotierte Elemente
| Element | Typ | Start | Ende | Länge | Strang |
|---|---|---|---|---|---|
| 35S-Pro | Promotor misc_feature | 106 | 528 | 423 | + |
| TATA | Schnittstelle CDS | 494 | 500 | 7 | + |
| mEGFP | Kodierende Sequenz CDS | 627 | 1.005 | 379 | + |
| F64L/S65T - enhanced fluorescence | Schnittstelle misc_feature | 816 | 821 | 6 | + |
| ST-LS1 | Kodierende Sequenz CDS | 1.006 | 1.194 | 189 | + |
| mEGFP | Kodierende Sequenz CDS | 1.195 | 1.532 | 338 | + |
| A206K - monomeric protein | Schnittstelle misc_feature | 1.431 | 1.433 | 3 | + |
| OCS | Terminator misc_feature | 1.542 | 1.737 | 196 | + |
| Amp | Selektionsmarker misc_feature | 2.553 | 3.413 | 861 | + |
| ColE1 | Origin / Backbone misc_feature | 3.456 | 4.172 | 717 | + |
PromotorKodierende SequenzTerminatorSelektionsmarkerOrigin / BackboneT-DNA-Grenze (Border)Schnittstelle
Die Elementtypen werden aus den Bezeichnungen in der GenBank-Datei abgeleitet; maßgeblich ist die Datei selbst.
Zitierweise
Bitte zitieren Sie den Vektor im Methodenteil wie folgt.
p35s-LmEGFP (D360; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/p35s-LmEGFP; RRID:SCR_029231)Ihre Publikation verwendet einen unserer Vektoren? Schreiben Sie uns.