pGusXD C386
Vector de clonación pUC con MCS–GusX, para dicotiledóneas.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
Se abre en SnapGene Viewer (gratuito), Benchling, ApE y Geneious.
Sitios de restricción
| Corte único · sitio | Corta en | Ubicación |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 103 | entre ColE1 y GusX |
| XbaIT^CTAGA | 105 | entre ColE1 y GusX |
| NcoIC^CATGG | 113 | entre ColE1 y GusX |
| NotIGC^GGCCGC | 119 | entre ColE1 y GusX |
| SpeIA^CTAGT | 126 | entre ColE1 y GusX |
| BamHIG^GATCC | 132 | entre ColE1 y GusX |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 140 | entre ColE1 y GusX |
| PstICTGCA^G | 148 | entre ColE1 y GusX |
| EcoRIG^AATTC | 150 | entre ColE1 y GusX |
| HindIIIA^AGCTT | 156 | entre ColE1 y GusX |
| MluIA^CGCGT | 165 | entre ColE1 y GusX |
| BbsI (BpiI)GAAGAC(2/6) | 391 | en GusX |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 451 | en GusX |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 478 | en GusX |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 522 | en GusX |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 739 | en GusX |
| AarICACCTGC(4/8) | 784 | en GusX |
| SalIG^TCGAC | 1994 | entre GusX y OCS |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 2014 | en OCS |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2202 | entre OCS y Amp |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2204 | entre OCS y Amp |
| BglIIA^GATCT | 2214 | entre OCS y Amp |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 2225 | entre OCS y Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2231 | entre OCS y Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 4802 | entre ColE1 y GusX |
Corte doble: SfiI (118, 2208), EagI (119, 1803), PvuI (2383, 3428), PvuII (2352, 4865), AatII (534, 1566), XmnI (994, 3197).
Sin sitio: SphI, XhoI, NdeI, NheI, ClaI, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, MfeI, AgeI, NsiI, BsrGI, SacII.
Calculado a partir de la secuencia GenBank para 50 enzimas comunes; las posiciones son el corte en la hebra superior, sin metilación Dam/Dcm. Compare vectores en el buscador de sitios de restricción.
- Promotor 2
- MCS
- Gen 2
- GusX
- Características
- dicotiledóneas
- Otros marcadores
- Amp
- Tamaño
- 4984 bp, circular
- Fecha del registro
- 04-OCT-2017
Construcción
- MCS · 11 sitios únicos · en 103, 165
- SfiI ×2 · flanquea el MCS · en 118, 2208
Ligation of GusD-Hind-Sal* into pOCS-BM*
Extraído del archivo GenBank; compare todos los vectores en la tabla de múltiples casetes de expresión.
Elementos anotados
| Elemento | Tipo | Inicio | Fin | Longitud | Hebra |
|---|---|---|---|---|---|
| GusX | Secuencia codificante CDS | 182 | 1993 | 1812 | + |
| OCS | Terminador misc_feature | 1999 | 2194 | 196 | + |
| Amp | Marcador de selección misc_feature | 3010 | 3870 | 861 | + |
| ColE1 | Origen / backbone CDS | 3913 | 4629 | 717 | + |
PromotorSecuencia codificanteTerminadorMarcador de selecciónOrigen / backboneBorde del T-DNASitio
Los tipos de elemento se deducen de las anotaciones del archivo GenBank; la referencia es el propio archivo.
Cómo citar
Cite el vector así en la sección de Materiales y métodos.
pGusXD (C386; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pGusXD)¿Su artículo utiliza uno de nuestros vectores? Avísenos.