pUC et expression chez E. coli
pGusXD C386
Vecteur de clonage pUC avec MCS–GusX, pour les dicotylédones.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 103 | entre ColE1 et GusX |
| XbaIT^CTAGA | 105 | entre ColE1 et GusX |
| NcoIC^CATGG | 113 | entre ColE1 et GusX |
| NotIGC^GGCCGC | 119 | entre ColE1 et GusX |
| SpeIA^CTAGT | 126 | entre ColE1 et GusX |
| BamHIG^GATCC | 132 | entre ColE1 et GusX |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 140 | entre ColE1 et GusX |
| PstICTGCA^G | 148 | entre ColE1 et GusX |
| EcoRIG^AATTC | 150 | entre ColE1 et GusX |
| HindIIIA^AGCTT | 156 | entre ColE1 et GusX |
| MluIA^CGCGT | 165 | entre ColE1 et GusX |
| BbsI (BpiI)GAAGAC(2/6) | 391 | dans GusX |
| BstEII (Eco91I)G^GTNACC | 451 | dans GusX |
| HpaI (KspAI)GTT^AAC | 478 | dans GusX |
| BstBI (Bsp119I)TT^CGAA | 522 | dans GusX |
| EcoRV (Eco32I)GAT^ATC | 739 | dans GusX |
| AarICACCTGC(4/8) | 784 | dans GusX |
| SalIG^TCGAC | 1 994 | entre GusX et OCS |
| BsmBI (Esp3I)CGTCTC(1/5) | 2 014 | dans OCS |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2 202 | entre OCS et Amp |
| AflII (BspTI)C^TTAAG | 2 204 | entre OCS et Amp |
| BglIIA^GATCT | 2 214 | entre OCS et Amp |
| ApaI (PspOMI)GGGCC^C | 2 225 | entre OCS et Amp |
| KpnI (Acc65I)GGTAC^C | 2 231 | entre OCS et Amp |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 4 802 | entre ColE1 et GusX |
Double coupure : SfiI (118, 2 208), EagI (119, 1 803), PvuI (2 383, 3 428), PvuII (2 352, 4 865), AatII (534, 1 566), XmnI (994, 3 197).
Aucun site : SphI, XhoI, NdeI, NheI, ClaI, AscI, PacI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, MfeI, AgeI, NsiI, BsrGI, SacII.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Promoteur 2
- MCS
- Gène 2
- GusX
- Caractéristiques
- dicotylédones
- Autres marqueurs
- Amp
- Taille
- 4 984 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 04-OCT-2017
Construction
- MCS · 11 sites uniques · en 103, 165
- SfiI ×2 · encadre le MCS · en 118, 2 208
Ligation of GusD-Hind-Sal* into pOCS-BM*
Extrait du fichier GenBank ; comparez tous les vecteurs dans le tableau des cassettes d’expression multiples.
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| GusX | Séquence codante CDS | 182 | 1 993 | 1 812 | + |
| OCS | Terminateur misc_feature | 1 999 | 2 194 | 196 | + |
| Amp | Marqueur de sélection misc_feature | 3 010 | 3 870 | 861 | + |
| ColE1 | Origine / squelette CDS | 3 913 | 4 629 | 717 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
pGusXD (C386; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/puc/pGusXD; RRID:SCR_029231)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.