pHC-nCas9 F189
Vecteur CRISPR/Cas avec Cas9 nick.
GenBank (.gbk)SnapGene (.dna)FASTA.seq
S’ouvre dans SnapGene Viewer (gratuit), Benchling, ApE et Geneious.
Sites de restriction
| Enzyme à coupure unique · site | Coupe en | Emplacement |
|---|---|---|
| SpeIA^CTAGT | 69 | entre O1 et Cas9WT |
| BamHIG^GATCC | 75 | entre O1 et Cas9WT |
| SacI (Ecl136II)GAGCT^C | 131 | dans Cas9WT |
| BglIIA^GATCT | 382 | dans Cas9WT |
| AatII (ZraI)GACGT^C | 673 | dans Cas9WT |
| SapI (BspQI, LguI)GCTCTTC(1/4) | 1 285 | dans Cas9WT |
| NcoIC^CATGG | 1 554 | dans Cas9WT |
| StuI (Eco147I)AGG^CCT | 2 851 | dans Cas9WT |
| SphI (PaeI)GCATG^C | 3 398 | dans Cas9WT |
| SmaI (XmaI, TspMI)CCC^GGG | 4 289 | entre Cas9WT et O2 |
| XmnI (PdmI)GAANN^NNTTC | 4 569 | dans ORF-1 |
| PvuICGAT^CG | 4 800 | dans ORF-1 |
Double coupure : EcoRV (1 973, 4 361), SacII (626, 2 723).
Aucun site : EcoRI, HindIII, XbaI, SalI, PstI, KpnI, NotI, XhoI, NdeI, NheI, ClaI, ApaI, MluI, AscI, PacI, SfiI, SbfI, FseI, PmeI, SwaI, AvrII, BsiWI, MfeI, AgeI, BstBI, HpaI, NsiI, BsrGI, EagI, BstEII, BsaI, BbsI, BsmBI, AarI.
Calculé à partir de la séquence GenBank pour 50 enzymes courantes ; les positions correspondent à la coupure sur le brin supérieur, sans méthylation Dam/Dcm. Comparez les vecteurs dans la recherche de sites de restriction.
- Gène 2
- Cas9 nick
- Taille
- 5 909 bp, circulaire
- Date de l’enregistrement
- 17-AUG-2022
Ligation of F188p7D35s-C9Nick* into HC5-Spe-Xma*
Éléments annotés
| Élément | Type | Début | Fin | Longueur | Brin |
|---|---|---|---|---|---|
| O1 | Site CDS | 30 | 50 | 21 | + |
| 'Cas9WT | Séquence codante CDS | 120 | 4 286 | 4 167 | + |
| D10A | Site misc_feature | 160 | 160 | 1 | + |
| NLS | Site misc_feature | 4 236 | 4 283 | 48 | + |
| O2 | Site CDS | 4 307 | 4 327 | 21 | + |
| ORF-1 | Séquence codante CDS | 4 382 | 5 242 | 861 | + |
| ColE1 | Origine / squelette misc_feature | 5 245 | 5 909 | 665 | + |
| LC | Site misc_feature | 5 467 | 5 467 | 1 | + |
PromoteurSéquence codanteTerminateurMarqueur de sélectionOrigine / squeletteBordure de l’ADN-TSite
Les types d’éléments sont déduits des étiquettes du fichier GenBank ; c’est le fichier lui-même qui fait référence.
Comment citer
Citez le vecteur ainsi dans la partie Matériel et méthodes.
pHC-nCas9 (F189; DNA Cloning Service e.K., Hamburg, Germany; https://dna-cloning.com/vectors/crispr/pHC-nCas9)Votre article utilise l’un de nos vecteurs ? Dites-le-nous.